259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0733 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0733  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
422 aa  818    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1064  natural resistance-associated macrophage protein  46.43 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.262705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  38.01 
 
 
412 aa  237  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  38.68 
 
 
398 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  38.48 
 
 
401 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  38.38 
 
 
406 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  36.18 
 
 
416 aa  212  9e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  37.06 
 
 
415 aa  209  5e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  38.42 
 
 
419 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  35.92 
 
 
403 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  35.92 
 
 
397 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  34.53 
 
 
408 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  28.13 
 
 
417 aa  106  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  27.69 
 
 
418 aa  99.8  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  26.87 
 
 
415 aa  99.8  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  26.29 
 
 
392 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  26.21 
 
 
392 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  25.61 
 
 
434 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  26.29 
 
 
392 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  26.29 
 
 
392 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  26.29 
 
 
413 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  25.47 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  29.6 
 
 
622 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.8 
 
 
420 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  27.84 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  27.07 
 
 
432 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  26.15 
 
 
412 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.15 
 
 
412 aa  94  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  26.15 
 
 
412 aa  94  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  26.15 
 
 
412 aa  94  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  26.15 
 
 
412 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  26.15 
 
 
412 aa  94  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  26.15 
 
 
412 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  26.15 
 
 
412 aa  94  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  26.15 
 
 
412 aa  94  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  25.77 
 
 
412 aa  93.6  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.67 
 
 
432 aa  93.6  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  28.04 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  25.52 
 
 
409 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  25.52 
 
 
409 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  26.83 
 
 
442 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  29.39 
 
 
625 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  24.5 
 
 
432 aa  86.3  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  27.66 
 
 
453 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  25.13 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  30.22 
 
 
627 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  25.82 
 
 
425 aa  83.6  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  28.7 
 
 
438 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.65 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  28.7 
 
 
438 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  28.7 
 
 
438 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  28.27 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  24.87 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  26.53 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  29.24 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  28.66 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  28.76 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  28.76 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  28.76 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  28.76 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  28.76 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  28.09 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  25.26 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  26.5 
 
 
463 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  23.82 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  27.11 
 
 
441 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2243  manganese transport protein MntH  27.69 
 
 
464 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  29.3 
 
 
447 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0331  manganese transport protein MntH  29.37 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.243423  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  26.28 
 
 
439 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  28.07 
 
 
444 aa  77.4  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  29.93 
 
 
444 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  25.53 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  26.81 
 
 
432 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  26.1 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  25.53 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  25.58 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0302  manganese transport protein MntH  29.37 
 
 
452 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0831169  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.32 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1912  manganese transport protein MntH  27.69 
 
 
460 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  31.39 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  26.11 
 
 
438 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  23.97 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.04 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  25.06 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  26.82 
 
 
442 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  28.06 
 
 
452 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  25.65 
 
 
442 aa  73.2  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  28.69 
 
 
451 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  25.53 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.45 
 
 
450 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  25 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  26.81 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3092  Mn2+/Fe2+ transporter  28.13 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612928  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  22.77 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  32.08 
 
 
438 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27409  Nramp family transporter: metal ion  24.75 
 
 
489 aa  70.1  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  24.26 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.37 
 
 
463 aa  70.1  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  28.25 
 
 
418 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>