155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17030 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  100 
 
 
429 aa  840    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  57.07 
 
 
415 aa  464  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  52.68 
 
 
433 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  53.47 
 
 
446 aa  383  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  45.39 
 
 
427 aa  343  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  27.57 
 
 
433 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.23 
 
 
434 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  27.45 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  29.77 
 
 
453 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  27.41 
 
 
419 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  27.93 
 
 
401 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  25.62 
 
 
468 aa  89.7  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  26.27 
 
 
406 aa  89.7  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  25.82 
 
 
440 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  25.92 
 
 
397 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  23.6 
 
 
439 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  25.62 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  24.86 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  24.58 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  24.94 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1353  natural resistance-associated macrophage protein  29.01 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.573768  normal  0.0815096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  24.81 
 
 
401 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  23.11 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  25.07 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  22.77 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  22 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.94 
 
 
415 aa  73.2  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5209  putative Mn2+/Fe2+ transporter protein  25.72 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112749  normal  0.693685 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
659 aa  69.7  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  24 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  21.56 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  24.64 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.03 
 
 
423 aa  67  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  23.96 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  22.37 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  23.79 
 
 
428 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  25.08 
 
 
424 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  22.57 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  24.62 
 
 
434 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3643  natural resistance-associated macrophage protein  23.23 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.145249  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  25.38 
 
 
413 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  24.29 
 
 
424 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  24.29 
 
 
424 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  24.29 
 
 
424 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  24.41 
 
 
408 aa  63.2  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  23.77 
 
 
428 aa  63.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2242  natural resistance-associated macrophage protein  27.31 
 
 
447 aa  63.2  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  22.19 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2933  natural resistance-associated macrophage protein  26.3 
 
 
453 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  23.98 
 
 
421 aa  60.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  23.4 
 
 
425 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  22.31 
 
 
396 aa  60.1  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  23.68 
 
 
437 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  23.68 
 
 
437 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  24.46 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  26.2 
 
 
433 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  25.8 
 
 
422 aa  59.3  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  23 
 
 
424 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  20.2 
 
 
436 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  23.68 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1807  natural resistance-associated macrophage protein  22.66 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  18.81 
 
 
414 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  22.64 
 
 
435 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  19.5 
 
 
434 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  25.1 
 
 
422 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1661  manganese transporter NRAMP  22.57 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1695  hypothetical protein  22.57 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  26.91 
 
 
438 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0858  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.92 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.929447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  23.15 
 
 
450 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  23.15 
 
 
450 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  24.81 
 
 
437 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  24.81 
 
 
437 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  24.81 
 
 
437 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  24.81 
 
 
437 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  24.81 
 
 
437 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  24.58 
 
 
438 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2199  Mn2+/Fe2- transporter, NRAMP family  25.89 
 
 
414 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  24.58 
 
 
438 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  24.58 
 
 
438 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  24.58 
 
 
438 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  25 
 
 
434 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  24.92 
 
 
438 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.43 
 
 
432 aa  53.5  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  25 
 
 
434 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0733  natural resistance-associated macrophage protein  23.63 
 
 
422 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1167  hypothetical protein  25 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.367951  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  24.75 
 
 
463 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0222  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  22.38 
 
 
439 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  21.79 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1443  putative transmembrane transport protein  23.6 
 
 
413 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  20.42 
 
 
421 aa  50.4  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  20.7 
 
 
408 aa  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  22.52 
 
 
441 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  24.83 
 
 
417 aa  50.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  22.77 
 
 
412 aa  50.1  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  29.8 
 
 
452 aa  49.7  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  22.55 
 
 
431 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2183  manganese transporter NRAMP  24.31 
 
 
326 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0049052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4171  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.09 
 
 
433 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248736  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>