40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3404 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  1023    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  41.29 
 
 		 453 aa  337  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  38.85 
 
 		 468 aa  323  6e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  40.52 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  24.01 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.58 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  26.09 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  21.76 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.91 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  22.03 
 
 		 659 aa  61.6  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  21.58 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  21.64 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  22.1 
 
 		 436 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  23.14 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  24.19 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  25.81 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2992  hypothetical protein  28.36 
 
 		 487 aa  52  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  25.51 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  25.81 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  25.51 
 
 		 424 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  24.78 
 
 		 422 aa  50.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  25.81 
 
 		 424 aa  50.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  20.8 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  20.45 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  25.07 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  20.8 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  20.7 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  24.92 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  25.14 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  23.95 
 
 		 408 aa  47.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  25.07 
 
 		 428 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2437  hypothetical protein  31.58 
 
 		 481 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  23.68 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  23.33 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  29.13 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0143  hypothetical protein  32.88 
 
 		 611 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188427  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  26.09 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  20.78 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  22.99 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  22.13 
 
 		 444 aa  43.9  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>