82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2881 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  100 
 
 
468 aa  914    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  38.85 
 
 
508 aa  323  5e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  42.44 
 
 
440 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  41.74 
 
 
453 aa  298  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  24.73 
 
 
433 aa  96.7  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  26.1 
 
 
446 aa  90.1  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  25.62 
 
 
429 aa  89.7  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  24.76 
 
 
415 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  25.65 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  24.42 
 
 
424 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 
659 aa  67.8  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  21.35 
 
 
425 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  23.4 
 
 
437 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  23.4 
 
 
437 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  22.86 
 
 
434 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  23.38 
 
 
421 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  25.99 
 
 
435 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  33.17 
 
 
419 aa  57  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  25.98 
 
 
433 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  23.5 
 
 
422 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  22.58 
 
 
442 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0143  hypothetical protein  36.71 
 
 
611 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188427  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  22.38 
 
 
436 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  33.04 
 
 
438 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  24.44 
 
 
421 aa  53.5  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  24.36 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  25.79 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  32.91 
 
 
435 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.12 
 
 
434 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2992  hypothetical protein  24.5 
 
 
487 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  32.89 
 
 
431 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  25.34 
 
 
406 aa  51.2  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  23.36 
 
 
428 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  28.4 
 
 
414 aa  50.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  24.32 
 
 
428 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  32.17 
 
 
438 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  27.86 
 
 
441 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2437  hypothetical protein  27.55 
 
 
481 aa  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1807  natural resistance-associated macrophage protein  23.96 
 
 
401 aa  50.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3929  hypothetical protein  33.75 
 
 
142 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  30.82 
 
 
413 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  31.3 
 
 
438 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  22.87 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  31.82 
 
 
452 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  30.91 
 
 
437 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  30.91 
 
 
437 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  30.91 
 
 
437 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  28.95 
 
 
438 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  28.95 
 
 
438 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  28.95 
 
 
438 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  29.11 
 
 
434 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  29.11 
 
 
434 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  30.91 
 
 
437 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  30.91 
 
 
437 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  33.33 
 
 
424 aa  47.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  33.33 
 
 
424 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  33.33 
 
 
424 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  24.62 
 
 
435 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  25.66 
 
 
401 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  27.71 
 
 
431 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  27.71 
 
 
431 aa  47  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1915  manganese transport protein MntH  27.71 
 
 
431 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  27.54 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  27.71 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  27.71 
 
 
431 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  29.56 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  31.88 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  27.71 
 
 
431 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  27.71 
 
 
431 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  25.65 
 
 
412 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1718  manganese transport protein MntH  27.76 
 
 
431 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  29.73 
 
 
437 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  22.41 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  28.5 
 
 
431 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  27.31 
 
 
431 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  23.44 
 
 
430 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10942  manganese transport protein MntH  27.15 
 
 
429 aa  43.9  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  24.88 
 
 
404 aa  43.9  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  27.41 
 
 
420 aa  43.9  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  25.18 
 
 
442 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.18 
 
 
415 aa  43.5  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  30.25 
 
 
439 aa  43.5  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>