145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1669 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 659 aa  1300    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  29.2 
 
 		 413 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0179  hypothetical protein  45.26 
 
 		 257 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.36 
 
 		 486 aa  104  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  34.78 
 
 		 451 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  33.01 
 
 		 455 aa  92  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  29.29 
 
 		 556 aa  87.8  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  30.32 
 
 		 572 aa  87.8  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  29.1 
 
 		 572 aa  87  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  29.39 
 
 		 429 aa  86.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  29.26 
 
 		 572 aa  84.3  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  27.27 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  29.05 
 
 		 576 aa  84  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  29.21 
 
 		 578 aa  82.8  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  30.3 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  26.19 
 
 		 575 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  28.12 
 
 		 558 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  24.41 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  31.52 
 
 		 552 aa  81.3  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 565 aa  80.1  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  29.41 
 
 		 565 aa  80.1  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 565 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  30.21 
 
 		 565 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  23.62 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  29.38 
 
 		 558 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  29.41 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  30.93 
 
 		 569 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  22.53 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  26.67 
 
 		 557 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  29.33 
 
 		 564 aa  72  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  26.74 
 
 		 577 aa  70.1  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  26.44 
 
 		 558 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1659  signal transduction histidine kinase, LytS  26.8 
 
 		 565 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000213246  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  26.2 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2684  signal transduction histidine kinase, LytS  26.29 
 
 		 565 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.287497  hitchhiker  0.00116896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1674  signal transduction histidine kinase, LytS  26.29 
 
 		 565 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0178726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1696  signal transduction histidine kinase, LytS  26.29 
 
 		 565 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0311025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2593  signal transduction histidine kinase, LytS  26.8 
 
 		 560 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0091271  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  30.71 
 
 		 446 aa  67  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1549  signal transduction histidine kinase, LytS  27.72 
 
 		 560 aa  66.6  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2822  sensor histidine kinase  26.15 
 
 		 560 aa  65.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  28.04 
 
 		 561 aa  65.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  21.69 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  26.72 
 
 		 433 aa  63.9  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  29.03 
 
 		 567 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  31.72 
 
 		 568 aa  63.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  22.01 
 
 		 421 aa  63.9  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  26.34 
 
 		 403 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  26.88 
 
 		 576 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  26.8 
 
 		 560 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  25.66 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  26.8 
 
 		 560 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  31.58 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  30.48 
 
 		 561 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  30.48 
 
 		 561 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  30.48 
 
 		 561 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  30.48 
 
 		 561 aa  60.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  30.48 
 
 		 561 aa  60.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  29.74 
 
 		 556 aa  59.3  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  22.48 
 
 		 422 aa  57  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  24.93 
 
 		 421 aa  56.6  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  24.69 
 
 		 424 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  31.02 
 
 		 561 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  31.02 
 
 		 561 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  25.66 
 
 		 428 aa  56.6  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  25.66 
 
 		 428 aa  56.2  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  31.02 
 
 		 561 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  31.02 
 
 		 561 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  31.02 
 
 		 561 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  31.02 
 
 		 561 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  31.02 
 
 		 561 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  33.57 
 
 		 580 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  31.02 
 
 		 561 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  31.02 
 
 		 561 aa  55.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  23.62 
 
 		 435 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  21.59 
 
 		 396 aa  53.9  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  24.04 
 
 		 560 aa  53.9  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  23.6 
 
 		 442 aa  53.5  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  29.57 
 
 		 581 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  26.77 
 
 		 433 aa  53.9  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  23.83 
 
 		 439 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  22.86 
 
 		 419 aa  53.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  27.23 
 
 		 584 aa  52.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  27.23 
 
 		 584 aa  52.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  30.4 
 
 		 557 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  25.25 
 
 		 425 aa  52  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  28.7 
 
 		 581 aa  52  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  30.4 
 
 		 557 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2431  signal transduction histidine kinase, LytS  27.84 
 
 		 560 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000324417  normal  0.0100076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  30.4 
 
 		 557 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2501  signal transduction histidine kinase, LytS  27.84 
 
 		 560 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.443565  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2433  signal transduction histidine kinase, LytS  27.41 
 
 		 558 aa  52  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  30.4 
 
 		 557 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  30.4 
 
 		 557 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  24.12 
 
 		 414 aa  51.2  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  29.6 
 
 		 557 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  30.11 
 
 		 568 aa  50.4  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>