39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0498 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  819    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
659 aa  170  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.39 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  25.5 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  24.32 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  24.63 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  23.37 
 
 
421 aa  70.1  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  26.17 
 
 
424 aa  66.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  25.29 
 
 
425 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  23.65 
 
 
424 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  23.65 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  23.65 
 
 
424 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  23.36 
 
 
424 aa  60.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  23.77 
 
 
428 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  23.36 
 
 
424 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  23.56 
 
 
428 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  21.99 
 
 
421 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  23.4 
 
 
421 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  24.57 
 
 
468 aa  56.6  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  22.99 
 
 
428 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  25.31 
 
 
433 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  24.77 
 
 
382 aa  53.1  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  21.88 
 
 
433 aa  52.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  23.35 
 
 
434 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  23.35 
 
 
434 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  23.51 
 
 
401 aa  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  25.47 
 
 
421 aa  50.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  21.45 
 
 
434 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  23.76 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  23.03 
 
 
437 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  23.43 
 
 
436 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  23.03 
 
 
437 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  21.9 
 
 
396 aa  47.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  22.87 
 
 
427 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3929  hypothetical protein  34.94 
 
 
142 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  21.63 
 
 
421 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  24.56 
 
 
408 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  25.2 
 
 
416 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  21.07 
 
 
423 aa  43.5  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>