43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002393 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  90.91 
 
 		 421 aa  721    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  781    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  65.49 
 
 		 421 aa  490  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  51.28 
 
 		 425 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  51.15 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  50.38 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  50.77 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  50.51 
 
 		 424 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  52.74 
 
 		 422 aa  364  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  50.77 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  50.51 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  49.74 
 
 		 424 aa  362  6e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  50.89 
 
 		 422 aa  360  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  48.35 
 
 		 428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  48.61 
 
 		 421 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  47.19 
 
 		 428 aa  354  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  46.43 
 
 		 428 aa  353  4e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  48.49 
 
 		 428 aa  352  8e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  48.35 
 
 		 428 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  50.26 
 
 		 420 aa  344  2e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  46.95 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  48.03 
 
 		 382 aa  333  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  42.78 
 
 		 421 aa  300  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  40.51 
 
 		 423 aa  285  8e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  35.64 
 
 		 421 aa  245  9e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  37.25 
 
 		 434 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  38.6 
 
 		 452 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  35.05 
 
 		 437 aa  222  9e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  34.8 
 
 		 437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  35.54 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  35.58 
 
 		 435 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  35.78 
 
 		 434 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  35.78 
 
 		 434 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  33.98 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  36.41 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  33.74 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  35.16 
 
 		 422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  32.19 
 
 		 427 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  36.73 
 
 		 460 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  23.48 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  22.31 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  23.57 
 
 		 433 aa  53.1  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  21.38 
 
 		 415 aa  49.7  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>