11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3929 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3929  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  280  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  33.71 
 
 		 453 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  33.75 
 
 		 468 aa  50.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 659 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  32.95 
 
 		 433 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  29.9 
 
 		 427 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  34.94 
 
 		 413 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  33.33 
 
 		 420 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  31.25 
 
 		 421 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  25.56 
 
 		 433 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  30.26 
 
 		 429 aa  40.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>