61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0786 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  100 
 
 		 420 aa  832    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  52.59 
 
 		 433 aa  425  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  51 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  50.5 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  48.48 
 
 		 419 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  48.77 
 
 		 423 aa  378  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  48.44 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  50.26 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  44.09 
 
 		 421 aa  342  5e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  45.22 
 
 		 421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  43.47 
 
 		 424 aa  335  9e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  45.3 
 
 		 428 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  43.28 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  44.88 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  44.74 
 
 		 428 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  44.98 
 
 		 421 aa  319  5e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  44.67 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  44.91 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  44.67 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  44.42 
 
 		 424 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  44.42 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  42.21 
 
 		 422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  44.36 
 
 		 382 aa  296  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  40.86 
 
 		 422 aa  273  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  37.59 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  35.93 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  38.39 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  36.26 
 
 		 434 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  34.52 
 
 		 435 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  34.62 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  34.4 
 
 		 437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  33.99 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  36 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  34.97 
 
 		 433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  35.14 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  34.11 
 
 		 427 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  33.87 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  32.16 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  32.92 
 
 		 460 aa  186  7e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  31.03 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  24.16 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  23.89 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2933  natural resistance-associated macrophage protein  25.76 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  68.75 
 
 		 52 aa  50.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  23.59 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  21.25 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  21.59 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  27.53 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  29.87 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  21.97 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  26.04 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  22.35 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  27.46 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.72 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  25.9 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  29.27 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  29.27 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  30.49 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  23.08 
 
 		 433 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2242  natural resistance-associated macrophage protein  26.09 
 
 		 447 aa  43.1  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>