53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0146 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  100 
 
 		 452 aa  904    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  42.96 
 
 		 428 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  43.56 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  42.03 
 
 		 421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  42.79 
 
 		 424 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  42.51 
 
 		 425 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  43.24 
 
 		 428 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  42.29 
 
 		 424 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  42.29 
 
 		 424 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  42.29 
 
 		 424 aa  309  8e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  42.04 
 
 		 424 aa  309  8e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  41.63 
 
 		 424 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  41.08 
 
 		 422 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  39.4 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  39.57 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  40.09 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  41.26 
 
 		 433 aa  292  7e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  39.86 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  41.02 
 
 		 421 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  38.37 
 
 		 421 aa  290  4e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  39.21 
 
 		 421 aa  289  8e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  40.37 
 
 		 435 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  39.01 
 
 		 434 aa  282  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  41.47 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  39.01 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  38.6 
 
 		 396 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  38.39 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  37.8 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  38.11 
 
 		 428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  40.59 
 
 		 423 aa  268  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  37.14 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  41.75 
 
 		 422 aa  256  7e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  39.21 
 
 		 433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  37.37 
 
 		 421 aa  253  3e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  39.61 
 
 		 431 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  38.39 
 
 		 460 aa  253  7e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  37.07 
 
 		 427 aa  236  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  35.49 
 
 		 418 aa  236  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  37.62 
 
 		 422 aa  223  6e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  21.78 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  21.43 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  23.57 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  22.46 
 
 		 453 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  67.74 
 
 		 52 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  23.15 
 
 		 401 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  21.67 
 
 		 508 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  19.66 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  25.51 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  30.65 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  25.43 
 
 		 435 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3851  hypothetical protein  61.76 
 
 		 48 aa  43.9  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  23.22 
 
 		 440 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  23.53 
 
 		 418 aa  43.1  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>