45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1109 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  100 
 
 		 428 aa  854    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  98.36 
 
 		 428 aa  842    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  74.33 
 
 		 419 aa  619  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  68.97 
 
 		 421 aa  568  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  53.12 
 
 		 433 aa  425  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  49.88 
 
 		 423 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  51 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  48 
 
 		 421 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  47.19 
 
 		 396 aa  354  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  44.95 
 
 		 421 aa  334  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  40.81 
 
 		 425 aa  319  6e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  40.61 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  42.58 
 
 		 421 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  43.14 
 
 		 424 aa  302  9e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  41.42 
 
 		 428 aa  299  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  41.19 
 
 		 428 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  41.04 
 
 		 428 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  42.14 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  42.14 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  42.14 
 
 		 424 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  41.9 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  42.07 
 
 		 422 aa  286  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  41.62 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  41.69 
 
 		 422 aa  265  8e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  39.51 
 
 		 421 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  34.61 
 
 		 436 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  35.25 
 
 		 437 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  35.25 
 
 		 437 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  34.38 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  33.8 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  34.68 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  34.44 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  33.96 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  38.11 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  32.93 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  35.26 
 
 		 460 aa  206  6e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  32.77 
 
 		 427 aa  202  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  34.61 
 
 		 422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  34.54 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  24.93 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.79 
 
 		 429 aa  47.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  23.68 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 659 aa  47.4  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  64.52 
 
 		 52 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  29.41 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>