62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4143 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  100 
 
 		 440 aa  874    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  40.52 
 
 		 508 aa  346  6e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  42.44 
 
 		 468 aa  341  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  45.28 
 
 		 453 aa  322  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  25.89 
 
 		 429 aa  94.4  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  25.52 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  26.61 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  26.61 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  24.4 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  25.96 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  25.91 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  23.81 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  25.27 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  26.46 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.33 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  26.18 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  24.84 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  21.07 
 
 		 424 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  23.1 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  23.43 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  21.68 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  20.59 
 
 		 424 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  24.75 
 
 		 406 aa  54.3  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  21.48 
 
 		 659 aa  53.5  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  20.96 
 
 		 427 aa  53.5  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.92 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  23.08 
 
 		 433 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  20.9 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  21.22 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  19.95 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  20.95 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  19.95 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  21.56 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  24.07 
 
 		 442 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  20 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  20.86 
 
 		 428 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1807  natural resistance-associated macrophage protein  23.59 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  20.09 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  21.49 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  23.23 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  23.23 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  22.38 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  21.56 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  24.14 
 
 		 431 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  21.46 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  23.03 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  21.45 
 
 		 420 aa  47  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  23.03 
 
 		 441 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.91 
 
 		 444 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  22.9 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  23.28 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2183  manganese transporter NRAMP  20.94 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0049052  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  22.28 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  21.55 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  23.55 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  24.21 
 
 		 451 aa  44.3  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  22.93 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  22.71 
 
 		 447 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.21 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  21.47 
 
 		 439 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  21.1 
 
 		 422 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  20.39 
 
 		 435 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>