76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3546 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  100 
 
 
453 aa  890    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  41.29 
 
 
508 aa  337  2.9999999999999997e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  46.51 
 
 
440 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  41.74 
 
 
468 aa  299  8e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  29.98 
 
 
415 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  29.77 
 
 
429 aa  107  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  27.16 
 
 
433 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  26.97 
 
 
427 aa  96.3  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  24.22 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  25.42 
 
 
446 aa  66.6  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  23.6 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  25.21 
 
 
437 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  25.21 
 
 
437 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  25.21 
 
 
437 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  25.21 
 
 
437 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  25.21 
 
 
437 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  24.16 
 
 
433 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  22.31 
 
 
421 aa  62  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  23.7 
 
 
421 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  24.5 
 
 
424 aa  61.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  23.82 
 
 
421 aa  61.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  26.35 
 
 
422 aa  59.3  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  24.28 
 
 
437 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  24.28 
 
 
437 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  23.88 
 
 
433 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  26.17 
 
 
452 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  24.27 
 
 
428 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 
659 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  27.23 
 
 
401 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  26.37 
 
 
419 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  21.82 
 
 
436 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  24.7 
 
 
428 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.4 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  20.62 
 
 
416 aa  53.9  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  25.25 
 
 
406 aa  53.5  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  23.6 
 
 
434 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  25.81 
 
 
421 aa  53.1  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  24.65 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  23.29 
 
 
434 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  22.22 
 
 
435 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.19 
 
 
415 aa  53.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3929  hypothetical protein  32.61 
 
 
142 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2992  hypothetical protein  26.74 
 
 
487 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  25.56 
 
 
424 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  25.56 
 
 
424 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  22.6 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  28.82 
 
 
425 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  25.54 
 
 
435 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  24.7 
 
 
428 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0924  hypothetical protein  26.38 
 
 
491 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00779194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  25.88 
 
 
424 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0858  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.01 
 
 
413 aa  50.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.929447  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  22.62 
 
 
419 aa  50.1  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  25.24 
 
 
424 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  25.5 
 
 
422 aa  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  25.15 
 
 
427 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2437  hypothetical protein  22.52 
 
 
481 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  24.09 
 
 
442 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0143  hypothetical protein  32.04 
 
 
611 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188427  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  28.21 
 
 
433 aa  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  25.61 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  25.61 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  25.93 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  22.54 
 
 
438 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  22.6 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1822  Mn2+/Fe2+ transporter  24.67 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1876  natural resistance-associated macrophage protein  33.01 
 
 
409 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.61 
 
 
432 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  24.04 
 
 
429 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10942  manganese transport protein MntH  25.24 
 
 
429 aa  44.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  36.54 
 
 
428 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  25.09 
 
 
430 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4747  Mn2+/Fe2+ transporter  25.08 
 
 
408 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  29.14 
 
 
430 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  24.46 
 
 
412 aa  43.5  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0449  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.3 
 
 
418 aa  43.5  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>