60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3515 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  100 
 
 		 425 aa  845    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  83.63 
 
 		 424 aa  665    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  79.25 
 
 		 424 aa  623  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  78.27 
 
 		 424 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  79 
 
 		 424 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  78.27 
 
 		 424 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  79.25 
 
 		 424 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  77.06 
 
 		 421 aa  616  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  78.22 
 
 		 428 aa  616  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  77.97 
 
 		 428 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  77.97 
 
 		 428 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  79.06 
 
 		 382 aa  597  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  72.36 
 
 		 422 aa  549  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  51.58 
 
 		 421 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  51.28 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  51.75 
 
 		 421 aa  368  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  47.01 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  40.81 
 
 		 428 aa  319  6e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  40.33 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  43.78 
 
 		 419 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  43.28 
 
 		 420 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  47.06 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  41.28 
 
 		 421 aa  290  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  40.14 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  42.29 
 
 		 452 aa  260  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  37.71 
 
 		 437 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  37.71 
 
 		 437 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  38.81 
 
 		 434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  36.99 
 
 		 436 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  38.57 
 
 		 435 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  36.41 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  37.59 
 
 		 434 aa  242  7e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  38.19 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  38.94 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  36.1 
 
 		 431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  35.29 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  36.67 
 
 		 427 aa  216  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  35.73 
 
 		 460 aa  216  8e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  36.05 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  24.47 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  30.67 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  21.35 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  26.89 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  22.85 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.4 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  72.22 
 
 		 52 aa  57  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  22.75 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3851  hypothetical protein  80.65 
 
 		 48 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  24.19 
 
 		 508 aa  53.1  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  29.65 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  31.58 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  29.23 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  29.23 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  22.28 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  23.88 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2183  manganese transporter NRAMP  36.07 
 
 		 326 aa  46.6  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0049052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  27.97 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 659 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  34.38 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  32.39 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>