37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3850 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  100 
 
 
52 aa  103  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  88.46 
 
 
428 aa  94.4  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  86.54 
 
 
428 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  84.62 
 
 
428 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  85 
 
 
424 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  85 
 
 
424 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  82.5 
 
 
424 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  82.5 
 
 
424 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  82.5 
 
 
424 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  70 
 
 
421 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  90 
 
 
424 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  72.22 
 
 
425 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  66 
 
 
422 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  68.75 
 
 
420 aa  50.8  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  54.35 
 
 
419 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  57.89 
 
 
421 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  57.89 
 
 
422 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  67.74 
 
 
452 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  52.63 
 
 
421 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  59.38 
 
 
433 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  58.54 
 
 
423 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  64.52 
 
 
428 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  64.52 
 
 
428 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  64.71 
 
 
434 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  57.89 
 
 
434 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  57.89 
 
 
434 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  64.71 
 
 
436 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  61.29 
 
 
422 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  65.52 
 
 
433 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  58.06 
 
 
435 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  61.29 
 
 
437 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  61.29 
 
 
460 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  61.29 
 
 
437 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  54.05 
 
 
421 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  54.84 
 
 
421 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  58.06 
 
 
431 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  58.62 
 
 
427 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>