51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2179 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  100 
 
 		 460 aa  909    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  85.35 
 
 		 431 aa  682    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  71.4 
 
 		 435 aa  624  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  66.21 
 
 		 437 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  66.21 
 
 		 437 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  67.37 
 
 		 434 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  64.95 
 
 		 436 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  67.84 
 
 		 434 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  68.08 
 
 		 434 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  38.64 
 
 		 421 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  39 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  37.16 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  39 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  38.52 
 
 		 424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  38.28 
 
 		 424 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  38.41 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  38.28 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  38.41 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  36.6 
 
 		 425 aa  249  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  37.8 
 
 		 424 aa  246  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  38.33 
 
 		 421 aa  236  9e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  38.77 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  37.83 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  37.13 
 
 		 422 aa  234  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  34.52 
 
 		 428 aa  234  3e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  35.22 
 
 		 428 aa  234  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  39.36 
 
 		 433 aa  230  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  36.52 
 
 		 396 aa  227  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  36.79 
 
 		 419 aa  223  7e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  35.61 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  32.47 
 
 		 421 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  36.72 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  37.41 
 
 		 422 aa  210  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  33.73 
 
 		 420 aa  208  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  36.26 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  35.73 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  35.66 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  33.25 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  32.18 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  23.01 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  25.99 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  22.7 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  23.1 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  22.68 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  22.64 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  24.71 
 
 		 468 aa  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  25.58 
 
 		 429 aa  47.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  30.68 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  26.75 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  26.23 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  26.32 
 
 		 433 aa  43.9  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>