53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0572 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  833    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  38.85 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  39.76 
 
 		 422 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  37.18 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  35.51 
 
 		 427 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  39.51 
 
 		 428 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  39.51 
 
 		 428 aa  262  8e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  36.6 
 
 		 421 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  36.12 
 
 		 428 aa  252  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  36.12 
 
 		 428 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  35.63 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  37.59 
 
 		 420 aa  250  4e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  35.21 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  35.01 
 
 		 421 aa  247  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  35.96 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  35.96 
 
 		 424 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  36.78 
 
 		 424 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  35.64 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  36.41 
 
 		 425 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  35.47 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  36.59 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  35.71 
 
 		 424 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  36.08 
 
 		 419 aa  243  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  35.71 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  35.22 
 
 		 421 aa  242  7.999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  34.71 
 
 		 423 aa  242  9e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  38.37 
 
 		 452 aa  239  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  35.28 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  34.36 
 
 		 436 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  34.83 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  34.6 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  35.52 
 
 		 421 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  33.57 
 
 		 437 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  33.33 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  33.59 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  34.45 
 
 		 422 aa  216  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  32.46 
 
 		 435 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  32.31 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  31.36 
 
 		 460 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  22.32 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  25.07 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  23.38 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  22.31 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  24.14 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  22.26 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  23.92 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  23.27 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 659 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  22.89 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  22.94 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  23.33 
 
 		 508 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  23.63 
 
 		 433 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  23.86 
 
 		 435 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>