53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3632 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  79.25 
 
 		 425 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  100 
 
 		 424 aa  843    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  95.87 
 
 		 424 aa  763    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  98.82 
 
 		 424 aa  833    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  98.82 
 
 		 424 aa  836    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  86.05 
 
 		 428 aa  698    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  86.18 
 
 		 428 aa  702    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  86.65 
 
 		 428 aa  710    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  98.35 
 
 		 424 aa  830    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  76.92 
 
 		 421 aa  633  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  73.19 
 
 		 424 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  77.25 
 
 		 382 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  74.22 
 
 		 422 aa  568  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  51.37 
 
 		 421 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  50.77 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  50.24 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  47.76 
 
 		 433 aa  341  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  43.96 
 
 		 420 aa  310  2e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  44.05 
 
 		 419 aa  306  6e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  42.64 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  42.64 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  45.67 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  40.58 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  41.79 
 
 		 421 aa  278  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  38.9 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  38.9 
 
 		 437 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  41.75 
 
 		 452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  39.15 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  38.64 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  39.29 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  38.41 
 
 		 434 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  37.17 
 
 		 436 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  35.34 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  38.86 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  38.48 
 
 		 431 aa  229  6e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  36.12 
 
 		 427 aa  229  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  37.12 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  38.01 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  36.41 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.65 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  81.4 
 
 		 52 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  26.06 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  25.59 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  23.53 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  27.94 
 
 		 427 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  22.98 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  25.51 
 
 		 508 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3851  hypothetical protein  87.1 
 
 		 48 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  26.45 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  21.43 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  22.03 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  26.56 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  32.18 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>