50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4676 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4676  transporter  100 
 
 		 422 aa  823    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  44.93 
 
 		 433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  39.76 
 
 		 421 aa  297  3e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  38.66 
 
 		 418 aa  273  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  38.1 
 
 		 427 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  38.65 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  38.94 
 
 		 425 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  40.34 
 
 		 428 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  39.1 
 
 		 424 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  38.86 
 
 		 424 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  40.1 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  38.86 
 
 		 424 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  39.61 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  38.86 
 
 		 424 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  39.1 
 
 		 424 aa  243  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  38.07 
 
 		 421 aa  239  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  34.59 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  34.7 
 
 		 434 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  39.15 
 
 		 422 aa  230  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  36.41 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  41.75 
 
 		 452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  34.03 
 
 		 437 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  33.8 
 
 		 437 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  37.22 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  34.43 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  34.84 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  34.61 
 
 		 428 aa  209  9e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  35.56 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  34.37 
 
 		 428 aa  209  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  35.16 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  35.9 
 
 		 421 aa  202  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  32.2 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  41.64 
 
 		 431 aa  196  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  33.33 
 
 		 420 aa  192  8e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  35.34 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  34.63 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  32.4 
 
 		 421 aa  186  6e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  37.04 
 
 		 460 aa  186  8e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  34.39 
 
 		 422 aa  150  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  25.53 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  28.79 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  30.43 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  24.18 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  26.02 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  25.5 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 659 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  25.6 
 
 		 508 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  27.5 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  23.67 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  61.29 
 
 		 52 aa  43.1  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>