65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1097 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2227  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  84.69 
 
 		 394 aa  653    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1097  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  100 
 
 		 395 aa  772    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0028  permease (transport protein)  66.24 
 
 		 395 aa  543  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1443  putative transmembrane transport protein  59.1 
 
 		 413 aa  467  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4281  putative transmembrane transport protein  56.12 
 
 		 386 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3381  manganese transporter NRAMP  52.07 
 
 		 408 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.764333 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0711  transmembrane transport protein  48.17 
 
 		 406 aa  378  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119432  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0987  manganese transporter NRAMP  50.13 
 
 		 410 aa  371  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0438146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3559  hypothetical protein  47.07 
 
 		 416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5193  hypothetical protein  47.58 
 
 		 412 aa  351  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.249883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1695  hypothetical protein  48.69 
 
 		 409 aa  350  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1661  manganese transporter NRAMP  48.69 
 
 		 409 aa  350  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2199  Mn2+/Fe2- transporter, NRAMP family  47.7 
 
 		 414 aa  348  8e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19210  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  45.67 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5852  hypothetical protein  50 
 
 		 425 aa  346  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0575384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0496  hypothetical protein  46.6 
 
 		 410 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1167  hypothetical protein  50.52 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.367951  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0319  hypothetical protein  48.23 
 
 		 411 aa  335  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00410  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  44.56 
 
 		 426 aa  332  6e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5377  hypothetical protein  45.55 
 
 		 410 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0536  hypothetical protein  47.09 
 
 		 421 aa  304  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131848  decreased coverage  0.00419582 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000480  hypothetical protein  40.72 
 
 		 412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3271  manganese transporter NRAMP  38.92 
 
 		 412 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  26.1 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  23.02 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  22.53 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  23.99 
 
 		 398 aa  57  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  23.38 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  22.36 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0733  natural resistance-associated macrophage protein  25.14 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  24.63 
 
 		 412 aa  49.7  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  26.04 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  19.74 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  23.68 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1815  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.03 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  24.64 
 
 		 412 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  25.74 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  23.81 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  25.19 
 
 		 452 aa  47.8  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  23.81 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  21.62 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  23.14 
 
 		 432 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  24.75 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  21.61 
 
 		 434 aa  46.6  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  22.5 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2163  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  22.9 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1551  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  23.34 
 
 		 465 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.818102  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  23.81 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  23.75 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  23.27 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  23.17 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  23.17 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  23.17 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  23.17 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  23.17 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  23.17 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  23.17 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  23.17 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.17 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  23.37 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0599  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  22.45 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0613  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  22.45 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  23.71 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2053  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  22.31 
 
 		 450 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.087988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3254  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  22.31 
 
 		 450 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.104949  normal  0.486135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>