34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3559 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3559  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  789    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2199  Mn2+/Fe2- transporter, NRAMP family  61.73 
 
 		 414 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19210  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  59.11 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5193  hypothetical protein  59.45 
 
 		 412 aa  423  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.249883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00410  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  55.77 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0496  hypothetical protein  53.01 
 
 		 410 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5377  hypothetical protein  52.05 
 
 		 410 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31598  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5852  hypothetical protein  50 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0575384  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0319  hypothetical protein  51.96 
 
 		 411 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0028  permease (transport protein)  49.19 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0536  hypothetical protein  53.85 
 
 		 421 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131848  decreased coverage  0.00419582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1097  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  47.07 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1443  putative transmembrane transport protein  47.2 
 
 		 413 aa  349  4e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1695  hypothetical protein  45.66 
 
 		 409 aa  338  8e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1661  manganese transporter NRAMP  45.66 
 
 		 409 aa  338  8e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2227  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  46.06 
 
 		 394 aa  331  1e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0711  transmembrane transport protein  47.78 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3381  manganese transporter NRAMP  45.8 
 
 		 408 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.764333 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1167  hypothetical protein  46.56 
 
 		 414 aa  319  6e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.367951  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4281  putative transmembrane transport protein  49.6 
 
 		 386 aa  319  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0987  manganese transporter NRAMP  43.16 
 
 		 410 aa  293  5e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0438146  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000480  hypothetical protein  41.52 
 
 		 412 aa  280  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3271  manganese transporter NRAMP  40.11 
 
 		 412 aa  274  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  25.42 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  23.8 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  24.26 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  24.88 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  22.47 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  23.74 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  23.97 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.51 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  24.23 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  22.73 
 
 		 412 aa  43.5  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  25.5 
 
 		 419 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>