27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5377 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5377  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  805    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0496  hypothetical protein  86.34 
 
 		 410 aa  691    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5852  hypothetical protein  65.1 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0575384  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0319  hypothetical protein  65.24 
 
 		 411 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0536  hypothetical protein  60.2 
 
 		 421 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131848  decreased coverage  0.00419582 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19210  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  57.32 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3559  hypothetical protein  52.05 
 
 		 416 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5193  hypothetical protein  54.04 
 
 		 412 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.249883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00410  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  53.59 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2199  Mn2+/Fe2- transporter, NRAMP family  51.86 
 
 		 414 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0028  permease (transport protein)  49.34 
 
 		 395 aa  360  2e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1097  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  45.55 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2227  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  47.91 
 
 		 394 aa  329  6e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1443  putative transmembrane transport protein  46.9 
 
 		 413 aa  324  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1661  manganese transporter NRAMP  46.65 
 
 		 409 aa  319  5e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1695  hypothetical protein  46.65 
 
 		 409 aa  319  5e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0711  transmembrane transport protein  45.19 
 
 		 406 aa  315  9e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3381  manganese transporter NRAMP  43.8 
 
 		 408 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.764333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4281  putative transmembrane transport protein  45.24 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1167  hypothetical protein  46.53 
 
 		 414 aa  300  3e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.367951  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0987  manganese transporter NRAMP  42.78 
 
 		 410 aa  283  5.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0438146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3271  manganese transporter NRAMP  38.2 
 
 		 412 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000480  hypothetical protein  39.15 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  26.1 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  25.53 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  25.38 
 
 		 401 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  23.94 
 
 		 398 aa  47  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>