56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2227 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2227  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  100 
 
 		 394 aa  764    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1097  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  84.69 
 
 		 395 aa  680    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0028  permease (transport protein)  65.13 
 
 		 395 aa  526  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1443  putative transmembrane transport protein  61.48 
 
 		 413 aa  481  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3381  manganese transporter NRAMP  54.72 
 
 		 408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.764333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4281  putative transmembrane transport protein  55.29 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0711  transmembrane transport protein  51.36 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119432  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0987  manganese transporter NRAMP  51.48 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0438146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1695  hypothetical protein  49.21 
 
 		 409 aa  358  8e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1661  manganese transporter NRAMP  49.21 
 
 		 409 aa  358  8e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19210  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  46.1 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5193  hypothetical protein  50.13 
 
 		 412 aa  349  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.249883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3559  hypothetical protein  46.31 
 
 		 416 aa  348  9e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2199  Mn2+/Fe2- transporter, NRAMP family  48.17 
 
 		 414 aa  348  9e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0496  hypothetical protein  48.95 
 
 		 410 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1167  hypothetical protein  50 
 
 		 414 aa  345  1e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.367951  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5852  hypothetical protein  50 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0575384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5377  hypothetical protein  47.91 
 
 		 410 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31598  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0319  hypothetical protein  49.73 
 
 		 411 aa  332  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00410  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  44.42 
 
 		 426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000480  hypothetical protein  40.98 
 
 		 412 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3271  manganese transporter NRAMP  40.87 
 
 		 412 aa  308  9e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0536  hypothetical protein  47.56 
 
 		 421 aa  299  7e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131848  decreased coverage  0.00419582 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  23.08 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  25.52 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  24.21 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  22.08 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  22.9 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  23.89 
 
 		 419 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  22.56 
 
 		 434 aa  53.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  23.22 
 
 		 403 aa  53.5  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  23.47 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  22.9 
 
 		 452 aa  50.8  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  20.7 
 
 		 428 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0733  natural resistance-associated macrophage protein  24.61 
 
 		 422 aa  49.7  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  22.14 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  22.14 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  22.14 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  22.14 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  22.14 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  22.14 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0613  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  26.42 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  22.14 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  22.14 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  22.14 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  21.43 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0599  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  26.94 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  24.25 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  21.23 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1182  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  28.07 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1815  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  22.08 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  20.36 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  22.01 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  20.5 
 
 		 434 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  20.53 
 
 		 432 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  22.81 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>