54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0852 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0852  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family- like protein  100 
 
 
413 aa  794    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2276  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family- like protein  73.28 
 
 
420 aa  542  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  26.58 
 
 
403 aa  79  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  28.4 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  28.21 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  28.16 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  25.88 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  26.68 
 
 
415 aa  66.2  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  26.47 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  27.08 
 
 
463 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  29.69 
 
 
463 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  26.67 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  24.67 
 
 
415 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  26.98 
 
 
441 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  25.81 
 
 
439 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  25.44 
 
 
408 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1353  natural resistance-associated macrophage protein  26.4 
 
 
455 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.573768  normal  0.0815096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  27.37 
 
 
451 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  23.42 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  25.13 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.37 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  26.87 
 
 
442 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  25.23 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  24.21 
 
 
404 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.61 
 
 
444 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  25.96 
 
 
444 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  24.62 
 
 
434 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  26.28 
 
 
452 aa  47  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  24.03 
 
 
428 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  26.18 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  24.88 
 
 
435 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  23.48 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  23.16 
 
 
429 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  25.5 
 
 
622 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  22.29 
 
 
453 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  26.05 
 
 
428 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  27.93 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  27.93 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  21.63 
 
 
420 aa  44.3  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  25.36 
 
 
438 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.38 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1807  natural resistance-associated macrophage protein  27.87 
 
 
401 aa  43.9  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1064  natural resistance-associated macrophage protein  29.89 
 
 
430 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.262705  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  25.42 
 
 
406 aa  43.9  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0541  Mn2+/Fe2+ transporter  29.09 
 
 
457 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  24.07 
 
 
432 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.45 
 
 
627 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  26.91 
 
 
429 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  24.79 
 
 
430 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  28.3 
 
 
468 aa  43.1  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  20.74 
 
 
430 aa  43.1  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  24.16 
 
 
437 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  24.86 
 
 
432 aa  43.1  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  24.16 
 
 
437 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>