225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3087 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  83.52 
 
 		 176 aa  274  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  71.59 
 
 		 176 aa  258  3e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  71.59 
 
 		 176 aa  258  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  32 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  34.66 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  26.47 
 
 		 178 aa  94.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  32.77 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  32.76 
 
 		 177 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  32.41 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  31.72 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  30.86 
 
 		 181 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  31.25 
 
 		 178 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  31.43 
 
 		 178 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  30.86 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  31.25 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  30.68 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  32.37 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  32 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  31.64 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  29.89 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  30.51 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  31.87 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  32.76 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  27.59 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  34.53 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  32.54 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  33.33 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  24.46 
 
 		 520 aa  58.2  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  25.85 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  26.53 
 
 		 478 aa  57  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  37.4 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  37.4 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  31.31 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  31.91 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  33.68 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  26 
 
 		 907 aa  54.7  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  29.08 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  29.08 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.61 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  28.3 
 
 		 515 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  31.63 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  27.46 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  36.84 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  29.79 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  34.67 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  30.14 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  35.77 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  27.12 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  28.74 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  28.87 
 
 		 518 aa  51.2  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  28.4 
 
 		 176 aa  50.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  24.8 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  32.88 
 
 		 141 aa  50.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  31.4 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  27.17 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  30 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0723  putative CheW protein  34.57 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  36.49 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  34.12 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  34.12 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  37.84 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  32 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  29.03 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  32 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  30.23 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  26.8 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  33.33 
 
 		 779 aa  49.3  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  29.03 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  31.47 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  31.9 
 
 		 533 aa  48.9  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  30.07 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  33.78 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  28.57 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  26.89 
 
 		 139 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  39.76 
 
 		 320 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  33.71 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  27.91 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  25.51 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  30.23 
 
 		 154 aa  47.8  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  36.92 
 
 		 162 aa  47.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  30.3 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  25.77 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  32.26 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  25.56 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  25.56 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0598  CheW protein  31.71 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  46.15 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  30.23 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  35.06 
 
 		 568 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  28.75 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  33.67 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  24.49 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  24.42 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  33.12 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  26.28 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  27.96 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  29.58 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  33.33 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>