More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3317 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  100 
 
 		 166 aa  328  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  62.05 
 
 		 166 aa  214  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  50.68 
 
 		 158 aa  135  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  46.9 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  40.36 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  40.36 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  45.18 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  40 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  44.59 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  44.68 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  40.25 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  40.25 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  42.86 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  45.71 
 
 		 147 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  37.04 
 
 		 160 aa  121  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  51.64 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  45.45 
 
 		 189 aa  120  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  45.93 
 
 		 163 aa  120  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  47.73 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  49.61 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  41.78 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  37.58 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  45.64 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  37.58 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  42.25 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  39.74 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  42.18 
 
 		 174 aa  114  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  39.24 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  40.82 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.33 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  34.42 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  40.69 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  39.24 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  49.61 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  38.51 
 
 		 174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  38.12 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  40 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  34.42 
 
 		 170 aa  111  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.62 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  37.5 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  38.41 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  38.3 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  34.59 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  46.56 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  34.62 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  39.04 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  39.07 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  39.29 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  40.79 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  33.77 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  42.75 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  35.53 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  35 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  40.15 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  38.31 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  40.15 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  40.15 
 
 		 171 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  37.66 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  37.66 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  40.15 
 
 		 174 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  38.96 
 
 		 169 aa  107  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  34.87 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  39.19 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  34.87 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  39.58 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  43.06 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  36.59 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  36.59 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  36.59 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  36.59 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  36.59 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  46.83 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  36.59 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  37.42 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  37.42 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  37.42 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  37.42 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  39.42 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  36.42 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  37.42 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  41.61 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  37.5 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  39.58 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  38.82 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  37.42 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  38.51 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  35.58 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  36.84 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  37.42 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  37.42 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  37.84 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  38.89 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  39.22 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  41.61 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  39.42 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  35.5 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  38.89 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.46 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  37.24 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  35.76 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>