More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2076 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  100 
 
 
170 aa  333  7.999999999999999e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  46.71 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  46.98 
 
 
167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  47.74 
 
 
168 aa  147  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  43.42 
 
 
183 aa  147  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  45.51 
 
 
165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  45.51 
 
 
165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  49.29 
 
 
158 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  50 
 
 
165 aa  140  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  50 
 
 
165 aa  140  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  47.68 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  44.23 
 
 
164 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  48.55 
 
 
165 aa  137  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  44.3 
 
 
164 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  47.73 
 
 
158 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  47.48 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  47.1 
 
 
164 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  44.2 
 
 
168 aa  134  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  43.67 
 
 
168 aa  134  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  43.57 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  41.72 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  46.21 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  41.84 
 
 
167 aa  131  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  40.85 
 
 
147 aa  131  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  43.7 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  38.31 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  41.3 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  48.74 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  43.07 
 
 
148 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  39.42 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  42.76 
 
 
159 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  45.53 
 
 
164 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  37.04 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  37.35 
 
 
175 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  39.58 
 
 
163 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  37.35 
 
 
175 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  37.35 
 
 
175 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  37.35 
 
 
175 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  37.35 
 
 
175 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  37.35 
 
 
175 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  36.54 
 
 
178 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  39.02 
 
 
183 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  37.35 
 
 
175 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  38.89 
 
 
163 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  38.41 
 
 
166 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  40 
 
 
174 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  45.45 
 
 
163 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  38.89 
 
 
163 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  42.66 
 
 
173 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  40.88 
 
 
163 aa  122  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  35.9 
 
 
178 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  42.76 
 
 
159 aa  121  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  38.56 
 
 
174 aa  121  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  38.06 
 
 
174 aa  121  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  38.06 
 
 
174 aa  120  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  36.94 
 
 
171 aa  120  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  40.43 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  34.97 
 
 
177 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  34.97 
 
 
177 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.1 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  36.31 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  41.55 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  42.47 
 
 
444 aa  119  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  37.23 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  41.43 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  37.25 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  40.98 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  43.8 
 
 
166 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  37.16 
 
 
175 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  36.5 
 
 
150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  36.84 
 
 
163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  41.61 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  41.43 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  41.43 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  38.67 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  37.34 
 
 
169 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  33.76 
 
 
170 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  46.22 
 
 
165 aa  117  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  35.57 
 
 
159 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  42.03 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  39.42 
 
 
160 aa  117  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  33.12 
 
 
170 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  36.18 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  36.36 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  37.23 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  41.01 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  36.62 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  36.62 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  36.62 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  37.96 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  35.76 
 
 
185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  38.24 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  39.29 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  36.36 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  40.82 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  40 
 
 
154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  38.97 
 
 
156 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  35.58 
 
 
170 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  39.42 
 
 
164 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  35.58 
 
 
170 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>