More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0876 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  100 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  81.55 
 
 		 168 aa  276  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  72.84 
 
 		 164 aa  239  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  72.22 
 
 		 165 aa  236  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  72.22 
 
 		 165 aa  236  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  72.33 
 
 		 165 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  72.37 
 
 		 164 aa  231  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  63.98 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  63.98 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  67.35 
 
 		 168 aa  209  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  56.44 
 
 		 167 aa  196  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  58.49 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  52.05 
 
 		 169 aa  154  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  49.03 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  46.31 
 
 		 189 aa  144  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2578  purine-binding chemotaxis protein CheW  61.61 
 
 		 126 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  55.37 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  55.37 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  49.28 
 
 		 147 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  44.74 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  52.89 
 
 		 158 aa  135  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  47.48 
 
 		 183 aa  134  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  48.25 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  49.61 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  42.67 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  41.61 
 
 		 518 aa  127  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  49.19 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  42.86 
 
 		 163 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  46.1 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  41.36 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  41.36 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  42.21 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  49.21 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.49 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  43.06 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  40.49 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  40.49 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  40.49 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  43.97 
 
 		 163 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  47.18 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  39.61 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.38 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  42.86 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  41.72 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  41.03 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.03 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  40.38 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  40.38 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  41.26 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  41.84 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  42.76 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  40.38 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  40.85 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  40.38 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  41.84 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.84 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  42.95 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  41.84 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  41.84 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  47.18 
 
 		 533 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  38.26 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  37.82 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  45.19 
 
 		 136 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  41.73 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  42.57 
 
 		 185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  39.31 
 
 		 169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  41.26 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  40.26 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  39.71 
 
 		 162 aa  117  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  40 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  40.44 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  38.51 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  33.99 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  43.15 
 
 		 218 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  41.91 
 
 		 148 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  39.46 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  43.04 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  39.44 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  39.44 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  40.82 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  40.54 
 
 		 159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  37.09 
 
 		 174 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  38.41 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  39.38 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  40.85 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  36.84 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  39.04 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  37.82 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  37.82 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  37.82 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  37.82 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  39.29 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  39.57 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  39.33 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  39.04 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  38.36 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  37.75 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  38.51 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>