More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3142 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  100 
 
 		 160 aa  315  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  62.34 
 
 		 158 aa  180  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  60.39 
 
 		 164 aa  175  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  58.39 
 
 		 170 aa  174  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  58.39 
 
 		 170 aa  174  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  45.39 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2120  CheW protein  43.12 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  49.31 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  43.75 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  45.95 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  42.47 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  41.56 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  40.29 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  43.92 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  38.93 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  46.61 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  39.19 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  39.19 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  45.76 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  44.92 
 
 		 158 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  35.81 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  39.86 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  39.86 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  38.19 
 
 		 159 aa  120  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  34.46 
 
 		 150 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  40.82 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  47.06 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  43.33 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  46.67 
 
 		 179 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  40.14 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  36.24 
 
 		 218 aa  117  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  42.86 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.14 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  40.71 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  45.83 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  40.74 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  45.83 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  38.1 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  36.3 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  40.85 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  42.07 
 
 		 147 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  36.55 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  36.3 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  37.24 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  36.99 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  39.86 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  43.22 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  36.99 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  36.3 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  44.97 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  34.67 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  35.17 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  37.67 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.3 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  36.3 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  36.3 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  40 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  36.3 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  35.62 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  34.93 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  34.48 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  35.62 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  33.1 
 
 		 170 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  33.1 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  33.1 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  37.96 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  32.41 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  35.62 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.93 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  35.62 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  35.62 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  34.93 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  34.93 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  34.93 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  35.62 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  34.93 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  32.89 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.62 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  34.93 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  40.3 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.41 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  31.37 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  31.37 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  32.87 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  34.93 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  31.37 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  32.28 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  31.37 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  31.37 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  32.28 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  30.72 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  38.93 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  34.93 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>