More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4025 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  100 
 
 		 165 aa  328  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  100 
 
 		 165 aa  328  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  81.37 
 
 		 165 aa  265  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  72.62 
 
 		 168 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  72.22 
 
 		 164 aa  236  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  70.12 
 
 		 164 aa  230  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  69.14 
 
 		 164 aa  224  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  64.02 
 
 		 168 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  58.79 
 
 		 165 aa  196  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  58.79 
 
 		 165 aa  196  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  55.56 
 
 		 167 aa  181  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  54.04 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  49.66 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  52.71 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  54.55 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  54.55 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  50 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  54.55 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  49.26 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  47.86 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  45.32 
 
 		 183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  45.14 
 
 		 189 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  40.36 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  47.24 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2578  purine-binding chemotaxis protein CheW  55.65 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  49.18 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  45.52 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  48.89 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  43.45 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  44.93 
 
 		 147 aa  123  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  45.32 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  43.62 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  39.86 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  47.62 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  41.5 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  42.41 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  40.4 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  39.74 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  40.4 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  41.67 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.4 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  40.97 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  36.84 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  39.33 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  42.25 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  37.16 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  40.97 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.56 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  39.04 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  40.74 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  40.56 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  40.56 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  40.54 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  40.56 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.56 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  41.4 
 
 		 218 aa  114  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  37.75 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  43.7 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  42.65 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  39.44 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  36.2 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  43.45 
 
 		 163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  36.02 
 
 		 165 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  36.02 
 
 		 165 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  35.44 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  35.58 
 
 		 167 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  35.58 
 
 		 167 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  35.58 
 
 		 167 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  35.58 
 
 		 167 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  35.58 
 
 		 167 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  35.58 
 
 		 167 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  35.58 
 
 		 167 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  35.58 
 
 		 167 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  39.86 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  39.86 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  39.86 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  39.86 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  40.88 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  39.57 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  39.16 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  39.86 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  37.34 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.34 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  37.41 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  37.34 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  37.84 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  33.13 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3975  CheW protein  41.48 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000746819 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  42.07 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  37.34 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  35.03 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  39.46 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  36.02 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  33.94 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  37.34 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  42.07 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  35.58 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  39.86 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  40.56 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>