More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0243 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  100 
 
 
163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  67.11 
 
 
167 aa  202  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  60.13 
 
 
163 aa  201  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  59.35 
 
 
162 aa  188  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  52.14 
 
 
183 aa  159  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  50 
 
 
158 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  57.63 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  56.78 
 
 
158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  50 
 
 
168 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  56.78 
 
 
158 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  48.61 
 
 
164 aa  140  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  45.83 
 
 
159 aa  140  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  45.39 
 
 
160 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  56.78 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  49.26 
 
 
147 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  45.39 
 
 
164 aa  134  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  44.14 
 
 
168 aa  133  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  45.64 
 
 
518 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  44.78 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  48.25 
 
 
164 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  49.29 
 
 
165 aa  131  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  45.28 
 
 
189 aa  130  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  42.76 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  51.41 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  48.18 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  43.42 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  45.19 
 
 
148 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  43.06 
 
 
165 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  43.06 
 
 
165 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  48.51 
 
 
163 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  51.18 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  45.52 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  41.45 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  45.52 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  47.79 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  50.67 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  43.54 
 
 
169 aa  124  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  41.96 
 
 
159 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  41.96 
 
 
159 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  43.17 
 
 
145 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  43.71 
 
 
164 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  45.21 
 
 
165 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  41.26 
 
 
162 aa  121  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  43.26 
 
 
171 aa  121  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  42.14 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  38.89 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  41.67 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  43.07 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  42.03 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  40.14 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.94 
 
 
164 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  42.86 
 
 
159 aa  118  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  47.52 
 
 
169 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  41.73 
 
 
171 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  41.73 
 
 
177 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  41.73 
 
 
171 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  41.73 
 
 
177 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  39.47 
 
 
163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  43.75 
 
 
173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  41.73 
 
 
171 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.03 
 
 
164 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  42.38 
 
 
158 aa  117  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  41.89 
 
 
154 aa  117  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  41.1 
 
 
175 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  44.78 
 
 
238 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  41.01 
 
 
171 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.03 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  40.56 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  39.16 
 
 
162 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  37.84 
 
 
163 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  46.85 
 
 
533 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  37.58 
 
 
163 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.97 
 
 
164 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  40.28 
 
 
161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  40.28 
 
 
163 aa  114  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  40.29 
 
 
178 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  41.04 
 
 
141 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  46.27 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  42.75 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  40.29 
 
 
178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.58 
 
 
164 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  37.5 
 
 
164 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  42.54 
 
 
163 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  39.58 
 
 
164 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  39.58 
 
 
164 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  39.58 
 
 
164 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  40.29 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  40.29 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  40.29 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  38.1 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  40.29 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  39.58 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  40.29 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  40.29 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  39.58 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  40.29 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  38.1 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  45.59 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  41.73 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  39.57 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>