More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4419 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  100 
 
 		 165 aa  330  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  81.37 
 
 		 165 aa  265  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  81.37 
 
 		 165 aa  265  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  75.84 
 
 		 168 aa  235  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  72.33 
 
 		 164 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  68.94 
 
 		 164 aa  231  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  66.67 
 
 		 164 aa  224  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  62.65 
 
 		 168 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  56.79 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  56.79 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  56.76 
 
 		 165 aa  183  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  50.61 
 
 		 167 aa  175  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  54.9 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  54.69 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  56.2 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  56.2 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  46.62 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  56.2 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  48.28 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  48.15 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  53.1 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  45.32 
 
 		 183 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  49.18 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  49.29 
 
 		 163 aa  131  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  40 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  44.44 
 
 		 189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  46.32 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2578  purine-binding chemotaxis protein CheW  54.46 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  44.52 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  45.39 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  43.7 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  47.37 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  43.17 
 
 		 159 aa  124  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  39.74 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  43.57 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3975  CheW protein  42.96 
 
 		 141 aa  120  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000746819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  41.13 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  41.13 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  41.13 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  41.13 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  40.82 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  39.6 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  38.71 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  35.66 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  41.13 
 
 		 139 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  41.73 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  45.19 
 
 		 136 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  38.62 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  38.62 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  38.06 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  38.62 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  38.62 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  38.62 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  38.62 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  40.85 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  38.62 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  38.62 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  38.31 
 
 		 165 aa  117  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  37.66 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  37.66 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  40.43 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  40.28 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  40.28 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  38.51 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  38.97 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  38.46 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  38.93 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  41.38 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  41.48 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  43.17 
 
 		 218 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  43.57 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  40 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  36.18 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  36.24 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  38.1 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  36.18 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  41.18 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  38.82 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  38.82 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  36.76 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  36.76 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.72 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  38.51 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  37.5 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  39.72 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  39.72 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  39.72 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  37.25 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  39.72 
 
 		 163 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  37.76 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  37.76 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  37.93 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  38.85 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  37.76 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  35.19 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  37.76 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.72 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  37.76 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  39.01 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  35.53 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>