More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3887 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  100 
 
 		 141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3975  CheW protein  97.16 
 
 		 141 aa  271  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000746819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  42.96 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  43.7 
 
 		 165 aa  124  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.7 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  42.22 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  42.96 
 
 		 165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  41.91 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  40.74 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  40.74 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  42.22 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  42.34 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  38.52 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  38.52 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  42.22 
 
 		 164 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  38.35 
 
 		 183 aa  107  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  38.36 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  50 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  44.83 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  38.03 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  35.56 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  35.56 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  35.56 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  41.67 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  34.81 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  34.81 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  34.81 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  34.07 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  41.74 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  34.27 
 
 		 218 aa  101  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  37.59 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  36.84 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  35.46 
 
 		 160 aa  100  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  40.87 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  34.53 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  39.67 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  36.09 
 
 		 174 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  36.09 
 
 		 174 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  40.78 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  34.33 
 
 		 171 aa  96.7  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  35.34 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  38.35 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  36.09 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  35.34 
 
 		 175 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  35.77 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  36.84 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  35.37 
 
 		 166 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  33.08 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  37.96 
 
 		 158 aa  94.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  37.31 
 
 		 158 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  36.09 
 
 		 178 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  36.03 
 
 		 520 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  36.09 
 
 		 174 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  36.09 
 
 		 178 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  33.57 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  37.59 
 
 		 183 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  36.09 
 
 		 165 aa  94  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  33.08 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  36.09 
 
 		 165 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  34.59 
 
 		 165 aa  93.6  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  34.59 
 
 		 167 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  34.59 
 
 		 167 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  38.17 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  33.08 
 
 		 165 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  33.08 
 
 		 165 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  34.59 
 
 		 167 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  34.59 
 
 		 167 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  33.08 
 
 		 165 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  34.59 
 
 		 167 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  34.59 
 
 		 167 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  34.59 
 
 		 167 aa  92.8  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  34.59 
 
 		 167 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  34.59 
 
 		 167 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  34.59 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  33.82 
 
 		 175 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  33.82 
 
 		 175 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  36.5 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  33.83 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  33.82 
 
 		 175 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  36.5 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  33.82 
 
 		 175 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  33.82 
 
 		 175 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  36.5 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  36.5 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  36.5 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  34.59 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  34.59 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  36.5 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  34.59 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  35.04 
 
 		 185 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  34.59 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  36.84 
 
 		 164 aa  92  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  33.82 
 
 		 175 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  36.5 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  33.83 
 
 		 174 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  33.82 
 
 		 175 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  36.09 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  33.83 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  34.53 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>