More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1297 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  100 
 
 
167 aa  330  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  100 
 
 
167 aa  330  7.000000000000001e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  100 
 
 
167 aa  330  7.000000000000001e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  330  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  100 
 
 
167 aa  330  7.000000000000001e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  100 
 
 
167 aa  330  7.000000000000001e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  100 
 
 
167 aa  330  7.000000000000001e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  100 
 
 
167 aa  330  7.000000000000001e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  99.4 
 
 
167 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  92.81 
 
 
167 aa  308  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  92.22 
 
 
167 aa  307  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  92.22 
 
 
167 aa  307  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  92.22 
 
 
167 aa  307  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  92.22 
 
 
167 aa  307  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  92.22 
 
 
167 aa  307  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  88.82 
 
 
165 aa  287  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  88.2 
 
 
165 aa  287  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  86.96 
 
 
165 aa  283  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  86.96 
 
 
165 aa  284  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  83.54 
 
 
166 aa  280  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  84.15 
 
 
165 aa  280  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  84.15 
 
 
165 aa  280  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  83.54 
 
 
165 aa  278  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  71.24 
 
 
174 aa  224  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  72.48 
 
 
175 aa  221  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  66.88 
 
 
164 aa  221  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  71.33 
 
 
171 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  71.81 
 
 
177 aa  220  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  71.81 
 
 
177 aa  220  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  71.81 
 
 
175 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  71.81 
 
 
175 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  71.81 
 
 
175 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  71.81 
 
 
175 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  71.81 
 
 
175 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  71.81 
 
 
171 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  71.81 
 
 
175 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  71.81 
 
 
175 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  71.33 
 
 
171 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  70.67 
 
 
178 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  71.33 
 
 
171 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  70.67 
 
 
178 aa  218  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  70 
 
 
175 aa  215  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  65.24 
 
 
164 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  69.03 
 
 
163 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  65.22 
 
 
164 aa  214  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  67.74 
 
 
163 aa  210  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  67.74 
 
 
163 aa  210  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  64.71 
 
 
167 aa  203  8e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  66.44 
 
 
174 aa  200  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  67.35 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  66.89 
 
 
174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  64.9 
 
 
174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  64.05 
 
 
163 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  64.63 
 
 
171 aa  193  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  62.42 
 
 
174 aa  192  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  63.27 
 
 
169 aa  190  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  63.38 
 
 
158 aa  189  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  62.94 
 
 
174 aa  189  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  61.22 
 
 
166 aa  186  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  62.68 
 
 
162 aa  186  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  62.68 
 
 
162 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02230  putative purine-binding chemotaxis protein  65.38 
 
 
161 aa  184  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139906  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  60.26 
 
 
166 aa  184  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0257  putative purine-binding chemotaxis protein  64.74 
 
 
161 aa  183  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  61.9 
 
 
187 aa  183  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  59.72 
 
 
170 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  59.15 
 
 
162 aa  182  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  59.72 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  59.72 
 
 
165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  58.67 
 
 
160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  59.72 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  57.62 
 
 
183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  60.81 
 
 
158 aa  181  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  60.96 
 
 
162 aa  180  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  58.17 
 
 
163 aa  179  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  59.03 
 
 
170 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  55.21 
 
 
170 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  59.03 
 
 
170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  59.46 
 
 
170 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  59.46 
 
 
170 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  59.46 
 
 
170 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  59.46 
 
 
170 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  59.46 
 
 
170 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  59.46 
 
 
170 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  59.46 
 
 
158 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  52.15 
 
 
170 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  55.41 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  55.7 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3125  CheW protein  56.41 
 
 
169 aa  165  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  53.21 
 
 
174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1759  putative CheW protein  55.19 
 
 
168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1963  CheW protein  55.19 
 
 
168 aa  160  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.187208  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24350  Chemotaxis protein  68.92 
 
 
166 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196922  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1476  CheW protein  53.38 
 
 
185 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.331722  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  42.26 
 
 
205 aa  145  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  46.71 
 
 
185 aa  144  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0157  chemotaxis protein CheW  56.29 
 
 
157 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  46.41 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0205  chemotaxis signal transduction protein  53.85 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  44.3 
 
 
183 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>