More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07620 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  100 
 
 
165 aa  318  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  45.77 
 
 
183 aa  141  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  46.45 
 
 
173 aa  136  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  45.21 
 
 
162 aa  136  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  41.45 
 
 
167 aa  134  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  42.47 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  47.55 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  40.85 
 
 
163 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  41.45 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  41.01 
 
 
147 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  42.22 
 
 
159 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  45.31 
 
 
158 aa  120  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  42.86 
 
 
158 aa  120  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  45.31 
 
 
158 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  46.15 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  43.18 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  40.82 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  44.76 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  42.54 
 
 
170 aa  117  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  39.1 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.04 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  45.19 
 
 
148 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  42.19 
 
 
165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  35.62 
 
 
165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  35.62 
 
 
165 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  39.73 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  39.73 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  37.31 
 
 
238 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  36.05 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  39.04 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  35.81 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  36.3 
 
 
168 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  39.84 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  36.55 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  34.25 
 
 
165 aa  111  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  35.17 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  38.85 
 
 
168 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  37.32 
 
 
518 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  38.85 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  38.85 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  32.03 
 
 
253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  43.62 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  34.9 
 
 
150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  33.56 
 
 
165 aa  107  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  38.92 
 
 
189 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  32.89 
 
 
178 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  32.45 
 
 
175 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  38.36 
 
 
150 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.68 
 
 
164 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  33.95 
 
 
163 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  35.25 
 
 
262 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  36.64 
 
 
166 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  30.52 
 
 
181 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.56 
 
 
164 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.48 
 
 
159 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  34.03 
 
 
167 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  29.3 
 
 
159 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  34.03 
 
 
167 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  34.03 
 
 
167 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  34.48 
 
 
159 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  34.48 
 
 
159 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  34.03 
 
 
167 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  34.48 
 
 
159 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  34.03 
 
 
167 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  31.79 
 
 
164 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  34.29 
 
 
177 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  34.29 
 
 
171 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  34.29 
 
 
177 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  34.29 
 
 
171 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  34.29 
 
 
171 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  33.78 
 
 
154 aa  106  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  33.12 
 
 
178 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  29.87 
 
 
185 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  32.19 
 
 
166 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  29.87 
 
 
185 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  34.75 
 
 
160 aa  105  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.75 
 
 
164 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  34.9 
 
 
150 aa  104  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  33.1 
 
 
167 aa  104  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  33.1 
 
 
167 aa  104  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  33.1 
 
 
167 aa  104  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  35.07 
 
 
159 aa  104  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  33.1 
 
 
167 aa  104  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  33.1 
 
 
167 aa  104  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 
167 aa  104  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  33.1 
 
 
167 aa  104  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  28.48 
 
 
161 aa  104  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  33.1 
 
 
167 aa  104  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  33.1 
 
 
167 aa  104  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  33.1 
 
 
159 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  35.06 
 
 
164 aa  104  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  33.1 
 
 
161 aa  104  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  35.06 
 
 
164 aa  104  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.17 
 
 
174 aa  103  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  33.33 
 
 
156 aa  103  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  33.57 
 
 
171 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  34.81 
 
 
184 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 
175 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 
175 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 
175 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>