More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0211 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  100 
 
 		 150 aa  288  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  94 
 
 		 150 aa  274  4e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  46.31 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  45.33 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  39.73 
 
 		 167 aa  122  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0388  CheW protein  40.27 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  34.46 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  35.17 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  34.48 
 
 		 170 aa  117  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  36.3 
 
 		 170 aa  117  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  41.73 
 
 		 147 aa  114  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  35.62 
 
 		 162 aa  113  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  35.37 
 
 		 183 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  40 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  45 
 
 		 166 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  44.17 
 
 		 158 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  44.17 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  39.19 
 
 		 173 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  39.29 
 
 		 192 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  34.9 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  36.73 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  38 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  37.14 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  39.13 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  36.43 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  37.41 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  42.5 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  35.46 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  35.46 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  36.05 
 
 		 165 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  36.05 
 
 		 165 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  36.17 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  35 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  43.97 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  35.14 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  40.41 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.71 
 
 		 164 aa  104  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  36.23 
 
 		 145 aa  104  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  35 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  37.93 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  34.9 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  37.78 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  34.29 
 
 		 165 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  32.64 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  44.17 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  35.62 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  33.79 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  39.84 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  36.43 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  38.73 
 
 		 518 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  30.67 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  39.57 
 
 		 169 aa  100  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  37.86 
 
 		 163 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  35.37 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 164 aa  99.4  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  35.97 
 
 		 158 aa  99.4  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  30.82 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  37.76 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.1 
 
 		 164 aa  98.6  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  30.87 
 
 		 166 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  38.51 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  30.82 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  37.16 
 
 		 157 aa  98.6  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  37.04 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  37.04 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  32.41 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  37.04 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  37.04 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  29.45 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  37.04 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  32.64 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  37.04 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  37.04 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  37.04 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  29.66 
 
 		 169 aa  97.8  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  32.64 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  35.81 
 
 		 189 aa  97.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  30.82 
 
 		 161 aa  97.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.73 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  35.56 
 
 		 166 aa  97.1  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  29.45 
 
 		 163 aa  97.1  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  28.97 
 
 		 162 aa  96.7  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  31.16 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.45 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  38.41 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  38.41 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  31.16 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  29.45 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  28.77 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  30.14 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  29.45 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  29.45 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  38.84 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  29.45 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  36.3 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  28.77 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  35.82 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  29.45 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  36.3 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.45 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>