More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0491 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  100 
 
 		 154 aa  301  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  60 
 
 		 148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  51.09 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  44.67 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  48.91 
 
 		 147 aa  133  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  48.46 
 
 		 145 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  42.86 
 
 		 183 aa  130  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  46.62 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  43.88 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  42.28 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  45.32 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  43.17 
 
 		 218 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  42.28 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  43.26 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  43.26 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  43.26 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  43.26 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  43.26 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  43.26 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  43.26 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  43.26 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  43.26 
 
 		 167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  43.26 
 
 		 167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  43.26 
 
 		 167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  43.26 
 
 		 167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  43.26 
 
 		 167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  42.55 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  41.61 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  43.57 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  40.56 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  42.5 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  40.26 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  39.46 
 
 		 163 aa  114  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  41.73 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  42.55 
 
 		 167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  40.71 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  40.71 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  40.71 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  43.7 
 
 		 163 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  43.7 
 
 		 163 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  36.94 
 
 		 178 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  43.7 
 
 		 163 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.73 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  41.38 
 
 		 163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1667  putative CheW protein  45.97 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.33191  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  39.46 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  39.29 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  41.43 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  39.13 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  41.91 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  41.43 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  39.86 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  42.11 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2282  CheW protein  39.55 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0124299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  40.91 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  39.85 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  40.71 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  41.13 
 
 		 174 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  40.58 
 
 		 164 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  41.96 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  39.87 
 
 		 194 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  41.13 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  41.13 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  41.13 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  41.13 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  41.13 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  38.62 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  41.13 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  41.43 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  41.13 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  42.07 
 
 		 163 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  43.09 
 
 		 164 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  39.87 
 
 		 192 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  39.26 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  39.26 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  38.69 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  39.22 
 
 		 194 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.85 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  39.31 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  40.6 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  39.85 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  38.73 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  39.1 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  39.35 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  39.85 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  40.71 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  40.43 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  40.43 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  38.3 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  40.28 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  39.85 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  45.19 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  37.67 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  39.33 
 
 		 194 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  39.72 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  34.81 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  40 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  39.72 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  39.26 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  38.73 
 
 		 175 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>