More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0809 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  100 
 
 		 163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  74.69 
 
 		 166 aa  221  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  66.87 
 
 		 165 aa  216  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  57.14 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  56.43 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  54.23 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  48.68 
 
 		 171 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  53.9 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  48.3 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  46.34 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  47.95 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  47.95 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  45.03 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  43.92 
 
 		 166 aa  127  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  41.55 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  41.26 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  36.91 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  38.16 
 
 		 174 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  39.58 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  41.91 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  40 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  36.94 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  36.94 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  36.94 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  36.94 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  36.94 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  36.94 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  36.94 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  36.94 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  39.26 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  40.79 
 
 		 170 aa  120  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  36.36 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  35.71 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  36.36 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  37.5 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  37.5 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.26 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.59 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  40.82 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  36.25 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  35.71 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  36.31 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  42.86 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  36.67 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  36.13 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  38.71 
 
 		 185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  36.13 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  36.13 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  36.13 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  36.88 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  36.88 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  36.88 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  36.88 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  36.88 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  35.03 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  34.53 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  39.07 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  37.24 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  39.73 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  39.73 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  34.53 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  34.53 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  34.53 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  34.53 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  34.53 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  36.67 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  37.84 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  33.96 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  35.51 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  43.51 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  34.53 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  39.44 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  42.07 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  39.04 
 
 		 184 aa  114  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  42.95 
 
 		 194 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  38.85 
 
 		 187 aa  114  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.87 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  42.95 
 
 		 194 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  42.95 
 
 		 194 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.06 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  36.11 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  34.25 
 
 		 178 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  36.3 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  36.67 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  41.22 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  40 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  33.33 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  38.41 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  33.33 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  39.31 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  33.33 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  37.24 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  42.19 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  39.42 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  34.25 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  34.62 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  34.72 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  41.38 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  34.62 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  34.72 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>