More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1208 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  100 
 
 		 179 aa  352  2e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  79.22 
 
 		 173 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  66.21 
 
 		 161 aa  197  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  65.75 
 
 		 161 aa  197  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  61.64 
 
 		 164 aa  193  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  58.11 
 
 		 163 aa  191  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  59.86 
 
 		 157 aa  191  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  61.74 
 
 		 163 aa  191  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  58.55 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  60.27 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  58 
 
 		 162 aa  187  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  57.14 
 
 		 178 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  57.33 
 
 		 167 aa  184  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  57.14 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  52.05 
 
 		 169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  57.24 
 
 		 164 aa  181  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  60.28 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  57.82 
 
 		 164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  48.85 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  54.42 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  46.95 
 
 		 171 aa  160  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  47.98 
 
 		 185 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  50 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  50 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  48.34 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  50.34 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  50.34 
 
 		 194 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  45.45 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  49.66 
 
 		 192 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  49.66 
 
 		 184 aa  140  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  44.59 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  44.3 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  46.26 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  44.94 
 
 		 179 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  46.01 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  49.3 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.89 
 
 		 178 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  46.21 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  43.24 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  42.31 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  45.33 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  43.42 
 
 		 167 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  44 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  44 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  40.79 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  39.57 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  41.38 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  39.33 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  41.1 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  40.85 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  38 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  37.27 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  36.88 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  39.73 
 
 		 163 aa  114  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  42.38 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  39.04 
 
 		 159 aa  114  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  37.24 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  38.56 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  42.57 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  38.1 
 
 		 161 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  38.31 
 
 		 174 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  36 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  37.24 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  36.88 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  37.91 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  41.27 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  41.5 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  41.01 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  37.33 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  35.92 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  36.05 
 
 		 164 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  42.42 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  35.5 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  40 
 
 		 158 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.89 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  40.8 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  36 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  34.67 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.73 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  38 
 
 		 165 aa  107  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  36.81 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  35.81 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  35.06 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  39.04 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  35.81 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  39.86 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  39.04 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  36.99 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.19 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  41.22 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  38.1 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  38.19 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  38.19 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  38.19 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  39.04 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  41.22 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  36.91 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  37.75 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  34.46 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  36.91 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>