More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04752 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  100 
 
 		 171 aa  342  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  56.1 
 
 		 185 aa  175  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  57.62 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  60 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  53.42 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  58.67 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  51.28 
 
 		 176 aa  154  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  53.24 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  57.45 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  50.62 
 
 		 169 aa  144  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  44.81 
 
 		 164 aa  140  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.67 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  48.67 
 
 		 194 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  47.52 
 
 		 185 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  44.94 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  48 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  48 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  44.14 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  44.59 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  43.15 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  43.27 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  41.83 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  46.21 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  39.73 
 
 		 183 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  43.42 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  37.65 
 
 		 178 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  44.44 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  42.04 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  41.4 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  37.42 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  44.06 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  42.11 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  42.11 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  39.73 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  44.74 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  37.33 
 
 		 218 aa  117  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  40.79 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  42.38 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  40.69 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  43.41 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  42.36 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  35.48 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  36.54 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  39.74 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  40.91 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  40 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  40.41 
 
 		 205 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  42.14 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  42.14 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  40.76 
 
 		 183 aa  107  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  41.41 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  37.25 
 
 		 183 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  38.41 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  41.41 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  36.36 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  38.46 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  39.22 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  36.31 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  36.31 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  36.31 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  34.78 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  36.31 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  36.31 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  36.31 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  38.46 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  36 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  37.78 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  36.3 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  41.78 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  36.11 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  36.81 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  40.41 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  36.55 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  35.42 
 
 		 183 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  31.65 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  37.58 
 
 		 175 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  33.13 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  39.86 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  41.56 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  41.56 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  33.33 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  33.13 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  38.89 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  33.13 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  33.33 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  30.63 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  29.76 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  30.63 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  32.92 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  31.21 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  33.56 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  31.21 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  30 
 
 		 166 aa  98.6  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  33.96 
 
 		 163 aa  98.2  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  37.04 
 
 		 162 aa  98.2  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  41.33 
 
 		 194 aa  98.2  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  35.62 
 
 		 161 aa  98.2  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  37.89 
 
 		 167 aa  98.2  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  31.01 
 
 		 167 aa  97.8  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  31.37 
 
 		 165 aa  97.8  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>