More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1347 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  100 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  68.79 
 
 		 161 aa  224  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  71.72 
 
 		 164 aa  217  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  67.97 
 
 		 164 aa  214  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  67.97 
 
 		 164 aa  214  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  67.97 
 
 		 164 aa  214  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  67.97 
 
 		 164 aa  214  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  64.15 
 
 		 159 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  66.24 
 
 		 159 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  69.66 
 
 		 162 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  64.15 
 
 		 159 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  63.52 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  71.03 
 
 		 163 aa  211  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  67.32 
 
 		 164 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  63.52 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  63.52 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  63.52 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  71.03 
 
 		 164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  66.67 
 
 		 164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  66.67 
 
 		 164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  66.67 
 
 		 164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  70.34 
 
 		 163 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  66.67 
 
 		 164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  69.66 
 
 		 161 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  66.01 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  66.23 
 
 		 164 aa  209  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  68.28 
 
 		 163 aa  207  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  69.66 
 
 		 164 aa  207  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  63.64 
 
 		 174 aa  204  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  63.64 
 
 		 164 aa  203  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  64.52 
 
 		 164 aa  203  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  62.03 
 
 		 161 aa  202  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  63.64 
 
 		 164 aa  203  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  63.64 
 
 		 164 aa  201  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  64.24 
 
 		 165 aa  199  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  61.54 
 
 		 162 aa  198  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  67.12 
 
 		 159 aa  197  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  65.52 
 
 		 161 aa  197  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  65.54 
 
 		 159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  62.59 
 
 		 163 aa  192  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3228  putative CheW protein  57.66 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000337303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  41.96 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  38.62 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  47.95 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  37.74 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  39.07 
 
 		 189 aa  120  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.44 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  42.66 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  36.99 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  34.67 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  37.89 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  36.05 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  42.07 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  37.58 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  43.7 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  35.62 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  42.86 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  40.85 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  40 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  39.46 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  34.67 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.24 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  38.51 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  36 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  41.38 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  39.04 
 
 		 179 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  37.16 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  34.97 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  34.97 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  34.23 
 
 		 163 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  33.77 
 
 		 164 aa  114  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  35.62 
 
 		 168 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  36.55 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  37.06 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  34.81 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  34.81 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  34.81 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  37.93 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  36.81 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  34.21 
 
 		 164 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  34.93 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  36.24 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.33 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.1 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  31.9 
 
 		 183 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  37.5 
 
 		 139 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  32.05 
 
 		 165 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  33.79 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  35.44 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  33.79 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  34.48 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  33.79 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  33.79 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  33.79 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  33.79 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  33.79 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  34.06 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  34.01 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  35.81 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  33.12 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>