More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4670 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  100 
 
 		 159 aa  322  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  76.58 
 
 		 162 aa  252  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  74.19 
 
 		 162 aa  239  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  79.31 
 
 		 165 aa  238  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  60.14 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  60.14 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  44.44 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  44.3 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  44.9 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  42.41 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  40.25 
 
 		 164 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0616  CheW protein  43.04 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  40.25 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.99 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  38.36 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  37.84 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  40.43 
 
 		 171 aa  124  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  39.35 
 
 		 163 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  38.51 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  39.31 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  38.61 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  37.82 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  36.02 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  36.84 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.16 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  35.81 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  36.08 
 
 		 160 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  37.32 
 
 		 185 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  35.71 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  37.32 
 
 		 185 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  36.05 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  35.8 
 
 		 194 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  35.37 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  36.49 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  36.3 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  36.3 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  36.81 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  35.06 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  36.24 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  38.46 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.51 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  35.17 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  34.27 
 
 		 169 aa  100  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  34.48 
 
 		 185 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  37.06 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  34.93 
 
 		 167 aa  99.8  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3562  CheW protein  34.72 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  35.71 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  35.17 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  37.68 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  34.25 
 
 		 187 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7838  CheW protein  34.51 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  34 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  38.46 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4315  chemotaxis protein  34.69 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  31.72 
 
 		 169 aa  97.8  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.93 
 
 		 164 aa  97.1  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  33.78 
 
 		 159 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  33.78 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  34.84 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.43 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  35.21 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  35.76 
 
 		 163 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  31.85 
 
 		 183 aa  95.5  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  34.42 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  35.42 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  35.21 
 
 		 163 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  35.51 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  36.43 
 
 		 175 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  32.64 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  32.41 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  34.84 
 
 		 179 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  36.3 
 
 		 174 aa  94.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  33.1 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  36.18 
 
 		 163 aa  94.4  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  33.1 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  39.04 
 
 		 158 aa  94.4  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  41.27 
 
 		 158 aa  94.4  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  31.33 
 
 		 194 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  41.27 
 
 		 158 aa  94.4  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  33.8 
 
 		 161 aa  94.4  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  30.97 
 
 		 194 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  30.97 
 
 		 194 aa  94  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  34.21 
 
 		 166 aa  94  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  34.23 
 
 		 161 aa  94  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  35.1 
 
 		 163 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  35.07 
 
 		 169 aa  93.6  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  35.1 
 
 		 163 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.39 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  33.8 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  40.48 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  32.64 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  31.76 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  32.39 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  32.39 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  32.39 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  31.03 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>