More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0143 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  100 
 
 		 162 aa  323  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  80.52 
 
 		 162 aa  258  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  76.82 
 
 		 165 aa  242  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  74.19 
 
 		 159 aa  239  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  58.62 
 
 		 162 aa  174  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  58.62 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  46.31 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  47.92 
 
 		 179 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  46.21 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  40.99 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0616  CheW protein  47.3 
 
 		 163 aa  140  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  38.85 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  40 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.74 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.19 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.46 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  35.71 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  38.26 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  36.42 
 
 		 178 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  36.67 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  37.58 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  36.24 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  35.62 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  39.07 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.29 
 
 		 164 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  38.56 
 
 		 179 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  34.93 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  36.17 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  37.5 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  33.74 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  37.09 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  36.88 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  39.47 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  36.17 
 
 		 185 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7838  CheW protein  36.62 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  38.13 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  38.57 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  36.17 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  35.29 
 
 		 170 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  37.32 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  35.37 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  35.66 
 
 		 194 aa  98.2  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  34.93 
 
 		 194 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  34.93 
 
 		 192 aa  97.1  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3562  CheW protein  34.44 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  34.18 
 
 		 194 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.67 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  33.1 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  36.17 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  34.25 
 
 		 194 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  34.18 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  35.92 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  36.81 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  34.04 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  33.56 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  34.51 
 
 		 185 aa  94.4  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4315  chemotaxis protein  33.33 
 
 		 175 aa  94.4  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  34.78 
 
 		 156 aa  94  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  35.42 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  38.06 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  35.25 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  32.88 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  37.24 
 
 		 147 aa  93.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  38.06 
 
 		 178 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  33.33 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  33.57 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  35.66 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  35.81 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  36.24 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  34.72 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  32.21 
 
 		 176 aa  91.3  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5776  CheW protein  35.51 
 
 		 185 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727432  normal  0.120994 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  34.03 
 
 		 163 aa  90.5  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4816  CheW protein  35.51 
 
 		 189 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  34.03 
 
 		 163 aa  90.9  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  32.62 
 
 		 162 aa  90.5  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  35.14 
 
 		 162 aa  90.5  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  35.14 
 
 		 162 aa  90.5  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  34.97 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  38.36 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  35.25 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  36.23 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  30.14 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  31.08 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  34.97 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  30.67 
 
 		 185 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4675  CheW protein  33.81 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  34.03 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  33.09 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  34.23 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  34.03 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  35.82 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  34.51 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  32 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  33.96 
 
 		 212 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  31.21 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  33.33 
 
 		 145 aa  87.8  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>