More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5776 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5776  CheW protein  100 
 
 
185 aa  357  5e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727432  normal  0.120994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4816  CheW protein  97.35 
 
 
189 aa  349  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  54.36 
 
 
156 aa  167  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7838  CheW protein  55.4 
 
 
155 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  51.68 
 
 
156 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4675  CheW protein  56.12 
 
 
157 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  45.27 
 
 
175 aa  130  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3562  CheW protein  44.6 
 
 
169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  45.83 
 
 
170 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  43.88 
 
 
170 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4315  chemotaxis protein  41.38 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0265  putative CheW protein  40.15 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  40.14 
 
 
179 aa  101  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  34.53 
 
 
167 aa  97.4  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0237  putative CheW protein  39.42 
 
 
163 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1585  chemotaxis protein, CheW2  39.42 
 
 
163 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  32.41 
 
 
171 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  33.09 
 
 
163 aa  95.9  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  34.53 
 
 
164 aa  95.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  34.53 
 
 
164 aa  94.4  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  33.81 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  32.37 
 
 
163 aa  93.2  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  33.09 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  31.51 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  31.76 
 
 
157 aa  92.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  34.25 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  34.33 
 
 
161 aa  91.7  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  35.97 
 
 
160 aa  91.3  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  35.51 
 
 
162 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  35.97 
 
 
158 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.37 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  35.51 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  34.78 
 
 
162 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  35.97 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  35.97 
 
 
162 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  31.65 
 
 
162 aa  88.2  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  31.65 
 
 
173 aa  87.8  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  31.43 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.86 
 
 
164 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.94 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.94 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  32.37 
 
 
169 aa  85.1  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  31.65 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  30.94 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  34.78 
 
 
147 aa  82  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  30.22 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  31.51 
 
 
194 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  31.51 
 
 
194 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  30.22 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  30.22 
 
 
181 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  32.37 
 
 
167 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  30.71 
 
 
148 aa  77  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0616  CheW protein  31.13 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662625  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  33.1 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  30.82 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  29.69 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  27.27 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  32.37 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  28.12 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  34.9 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  30.34 
 
 
167 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  30.94 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30.43 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  29.5 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  30.22 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  25.9 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  33.83 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  34.75 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  30.43 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  30.43 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  34.75 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  35.77 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  30.07 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  29.5 
 
 
164 aa  72  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  30.22 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  29.71 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  33.9 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  28.06 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  29.71 
 
 
159 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  28.26 
 
 
161 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  28.99 
 
 
159 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  28.06 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  29.79 
 
 
162 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  29.79 
 
 
162 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.99 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  28.99 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  26.57 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  28.99 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  28.03 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  28.99 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  34.96 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  30.22 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  28.99 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  30.36 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  23.42 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  32.37 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.26 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  26.35 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  28.26 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  28.26 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>