More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1144 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  64.77 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  63.16 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  60.82 
 
 		 179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  60.53 
 
 		 187 aa  201  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  62.75 
 
 		 176 aa  187  9e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  59.86 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  57.42 
 
 		 171 aa  174  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  52.63 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  50.3 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  49.11 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  46.02 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  51.97 
 
 		 192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  51.97 
 
 		 194 aa  160  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  50.33 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  52.52 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  45.73 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.9 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  45.12 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  50.64 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  49.34 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  44.51 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  45.51 
 
 		 157 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  44.65 
 
 		 164 aa  141  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  46.1 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  44.03 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  49.68 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  49.01 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  44.14 
 
 		 162 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  46.91 
 
 		 173 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  42.17 
 
 		 169 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  45.95 
 
 		 164 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  42.17 
 
 		 166 aa  131  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  45.95 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  39.24 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  38.82 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  40.65 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  40.12 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  43.84 
 
 		 183 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  37.58 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  37.97 
 
 		 164 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  38.89 
 
 		 181 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  45.58 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  43.41 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  43.41 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  40.85 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  43.7 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  44.52 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  41.78 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  41.43 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  38.06 
 
 		 178 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  37.67 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  37.89 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  38.56 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  36.14 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  39.02 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  37.09 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  36.75 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  40.13 
 
 		 156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  34.66 
 
 		 175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  37.58 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  37.67 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  36.59 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  39.04 
 
 		 163 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  38.55 
 
 		 164 aa  115  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  38.89 
 
 		 183 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  44.93 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  40.85 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  36.42 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  36.42 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  36.42 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  38.51 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  38.51 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  36.42 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  38.51 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  36.42 
 
 		 171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  36.42 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  36.42 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  38.51 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  36.42 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  36.42 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  36.42 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  36.42 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  36.42 
 
 		 171 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  41.38 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.75 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.12 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  39.19 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  40 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  38.12 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  38.12 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  38.36 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  38.12 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  37.89 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  38.51 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  37.74 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  37.41 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  35 
 
 		 167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  35 
 
 		 167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  35 
 
 		 167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>