More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1419 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  100 
 
 
159 aa  315  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  46.26 
 
 
183 aa  154  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  48.34 
 
 
162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  51.41 
 
 
158 aa  147  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  53.03 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  49.31 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  51.52 
 
 
158 aa  144  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  50.76 
 
 
158 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  45.1 
 
 
163 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  43.59 
 
 
167 aa  141  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  45.83 
 
 
163 aa  140  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  49.28 
 
 
145 aa  140  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  44.14 
 
 
154 aa  138  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  44.67 
 
 
154 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  47.59 
 
 
170 aa  135  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  50.41 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  42.47 
 
 
165 aa  131  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  50.75 
 
 
163 aa  131  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  43.17 
 
 
164 aa  130  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  46.43 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  39.35 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  42.21 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  50.78 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.88 
 
 
164 aa  127  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  45.21 
 
 
169 aa  127  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  42.65 
 
 
148 aa  127  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  43.06 
 
 
161 aa  127  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  42.86 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  43.45 
 
 
165 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  43.45 
 
 
165 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  43.45 
 
 
165 aa  124  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  43.45 
 
 
165 aa  124  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  45.53 
 
 
166 aa  124  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  43.17 
 
 
165 aa  124  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  41.67 
 
 
163 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  38.36 
 
 
178 aa  122  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  38.36 
 
 
178 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  41.1 
 
 
168 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  46.67 
 
 
148 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  38.36 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  39.86 
 
 
167 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  37.67 
 
 
175 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  39.29 
 
 
171 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  38.19 
 
 
160 aa  120  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  38.67 
 
 
165 aa  120  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  38.93 
 
 
171 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  38.51 
 
 
177 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  38.51 
 
 
177 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  40.4 
 
 
163 aa  120  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  40 
 
 
160 aa  120  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  38.51 
 
 
171 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  38.51 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  40.58 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  40.58 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  38.57 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  38.67 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  45.14 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  38.67 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  38.67 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  39.86 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  40.28 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  36.24 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  40.28 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  44.29 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  38.03 
 
 
174 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  40.69 
 
 
173 aa  118  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  37.82 
 
 
164 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  38.46 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  38.46 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  38.46 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  38.46 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  38.46 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  38.46 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  38.46 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  37.41 
 
 
187 aa  117  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  45.64 
 
 
189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  38.46 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  36.49 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  37.5 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  41.01 
 
 
159 aa  117  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  40.28 
 
 
164 aa  117  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  41.78 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1759  putative CheW protein  38.93 
 
 
168 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  39.07 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  37.67 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1963  CheW protein  38.93 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.187208  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  40.14 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  38.89 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3125  CheW protein  39.47 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  38.46 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  39.58 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  39.58 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  38.46 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  37.32 
 
 
174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>