More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0575 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  100 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  58.55 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  60.54 
 
 		 173 aa  187  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  51.97 
 
 		 163 aa  186  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  55.7 
 
 		 161 aa  181  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  50 
 
 		 169 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  52.38 
 
 		 162 aa  179  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  51.01 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  50.34 
 
 		 164 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  56.55 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  51.33 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  50.66 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  55.03 
 
 		 163 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  53.06 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  51.37 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  49.67 
 
 		 167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  46.58 
 
 		 164 aa  160  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  44.23 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  46.9 
 
 		 171 aa  157  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  45.89 
 
 		 164 aa  157  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  46.94 
 
 		 185 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  46.94 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  47.26 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  41.78 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  49.32 
 
 		 212 aa  134  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  42.41 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  40.99 
 
 		 194 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  41.1 
 
 		 185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  40.37 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  40.37 
 
 		 192 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  45.95 
 
 		 167 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  42.86 
 
 		 179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  38.61 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  41.03 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  39.04 
 
 		 187 aa  120  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  43.36 
 
 		 194 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  41.55 
 
 		 170 aa  120  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  40.38 
 
 		 179 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  37.35 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  37.34 
 
 		 169 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  42.66 
 
 		 194 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  42.66 
 
 		 194 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  37.33 
 
 		 179 aa  114  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  36.91 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  39.87 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  35.95 
 
 		 175 aa  114  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  39.73 
 
 		 184 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  32.26 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  41.01 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  37.33 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  38.13 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  36.84 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  36.91 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  34.59 
 
 		 163 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  37.5 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  36.05 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  38.31 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  35.21 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  36.99 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  40.58 
 
 		 191 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  40.58 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  34.9 
 
 		 169 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.1 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  38.41 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  37.91 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  38.85 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  35.57 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  35.76 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  34.62 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  32.91 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  33.54 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  35.15 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  33.54 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  36.3 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  33.97 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  32.93 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  33.55 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  32.93 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  32.93 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  33.56 
 
 		 164 aa  103  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  32.26 
 
 		 168 aa  103  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  37.84 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  35.37 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  34.97 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  32.65 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  33.33 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  34.69 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  36.24 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  36.24 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  35.37 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.97 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  33.55 
 
 		 171 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  34.97 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  34.97 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  34.97 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  39.1 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  35.62 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  35.81 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  33.79 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>