More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0911 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  100 
 
 
179 aa  357  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  92.13 
 
 
179 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  64.56 
 
 
185 aa  215  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  61.31 
 
 
184 aa  210  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  61.54 
 
 
187 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  60.62 
 
 
176 aa  192  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  63.89 
 
 
179 aa  181  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  55.56 
 
 
169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  49.38 
 
 
178 aa  165  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  58.67 
 
 
171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  50.32 
 
 
194 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  49.68 
 
 
192 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  49.68 
 
 
194 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  48.75 
 
 
185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  48.24 
 
 
169 aa  154  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  45 
 
 
163 aa  153  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  45.51 
 
 
157 aa  150  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  43.87 
 
 
178 aa  145  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.23 
 
 
164 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  46.58 
 
 
173 aa  141  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  42.77 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  43.51 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  44.94 
 
 
179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  44.37 
 
 
171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.14 
 
 
164 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  42.86 
 
 
164 aa  137  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  45.27 
 
 
169 aa  136  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  48.3 
 
 
183 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.51 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  42.95 
 
 
185 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  45.75 
 
 
163 aa  134  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  42.95 
 
 
185 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.57 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  40.13 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  45.58 
 
 
161 aa  132  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  43.23 
 
 
167 aa  132  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  42.58 
 
 
181 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  38.99 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  43.23 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  42.86 
 
 
167 aa  129  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  40.88 
 
 
205 aa  124  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  40.38 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  38.41 
 
 
160 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  39.38 
 
 
165 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  42.11 
 
 
194 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  42.76 
 
 
194 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  35.44 
 
 
164 aa  114  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  36.71 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  42.11 
 
 
194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  42.14 
 
 
191 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  42.14 
 
 
191 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  36.65 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  36.08 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.25 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  36.25 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  36.25 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  36.25 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  37.84 
 
 
162 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  36.25 
 
 
164 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  36.25 
 
 
164 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  36.25 
 
 
164 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  36.25 
 
 
164 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  36.36 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  37.09 
 
 
171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  37.09 
 
 
177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  37.09 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  37.09 
 
 
177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  36.24 
 
 
164 aa  111  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  41.84 
 
 
194 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  37.09 
 
 
171 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.88 
 
 
164 aa  111  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  36.08 
 
 
161 aa  111  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  37.09 
 
 
174 aa  111  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  35 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  40.26 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  38 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  39.76 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  40.65 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  36.08 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  36.42 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  36.54 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  36.73 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.73 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  36.73 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  36.73 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  34.9 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  35.48 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  36.25 
 
 
163 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  31.36 
 
 
218 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  35.1 
 
 
178 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  39.49 
 
 
156 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  37.25 
 
 
175 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  37.58 
 
 
162 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  35.1 
 
 
178 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  35.95 
 
 
164 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  38.26 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  35.53 
 
 
164 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  40.29 
 
 
157 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  36.42 
 
 
174 aa  108  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  36.05 
 
 
161 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>