More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0971 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  100 
 
 		 169 aa  333  9e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  46.2 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  44 
 
 		 169 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  38.61 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  38.06 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  38.06 
 
 		 170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  38.06 
 
 		 170 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  41.43 
 
 		 165 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  40.71 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  40.71 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  40.71 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  36.91 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  35.76 
 
 		 160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  43.14 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  35.81 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  35.26 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  35.26 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  35.26 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  34 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  35.26 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  35.26 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  35.26 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  35.26 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  35.26 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  35.26 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.33 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  32.91 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  35.95 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  33.94 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  32.67 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  32.67 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  34.97 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  33.93 
 
 		 174 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  33.73 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  34.27 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  34.27 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  34.27 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  34.27 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  34.27 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  36.24 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  34.62 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  40 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  34.62 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  34.62 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  34.62 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  34.62 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  34.62 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  34.81 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  33.78 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  38.46 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  35.03 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  41.73 
 
 		 165 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  32.47 
 
 		 178 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  34.39 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  33.79 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  40.58 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  34.84 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  40.58 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  40.58 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  41.73 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  40.58 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  40.58 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  32.67 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  40.58 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  40.58 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  43.18 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  32.89 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  33.11 
 
 		 167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  34.19 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  33.79 
 
 		 175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.84 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  37.5 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  35.54 
 
 		 185 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  37.58 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  34.27 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  36.05 
 
 		 163 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  36.65 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  35.44 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  36.94 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  36.43 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  39.57 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  32.43 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  39.57 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.33 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  32.26 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  34.03 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  38.36 
 
 		 184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  36.65 
 
 		 218 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  38.41 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>