More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0602 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  100 
 
 
194 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  98.78 
 
 
194 aa  320  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  98.17 
 
 
192 aa  319  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  78.77 
 
 
185 aa  267  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  49.14 
 
 
179 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  46.3 
 
 
187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  51.97 
 
 
184 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  50.98 
 
 
164 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  49.08 
 
 
179 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  59.29 
 
 
191 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  59.29 
 
 
191 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  58.87 
 
 
194 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  49.67 
 
 
164 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  48.99 
 
 
185 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  50 
 
 
169 aa  155  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  50 
 
 
178 aa  153  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  47.95 
 
 
163 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  49.32 
 
 
157 aa  153  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  50 
 
 
162 aa  152  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  49.67 
 
 
164 aa  151  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  50 
 
 
164 aa  151  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  49.31 
 
 
171 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  49.67 
 
 
164 aa  151  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  49.02 
 
 
164 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  50.67 
 
 
169 aa  149  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  42.78 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  41.99 
 
 
185 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  43.56 
 
 
167 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  49.65 
 
 
179 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  50.34 
 
 
179 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  50.35 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  44.59 
 
 
163 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  44.51 
 
 
173 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  45.64 
 
 
176 aa  138  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  45.77 
 
 
161 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.97 
 
 
178 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  44.67 
 
 
181 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  45.07 
 
 
161 aa  134  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  47.26 
 
 
169 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  41.72 
 
 
167 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  40.99 
 
 
164 aa  130  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  41.52 
 
 
194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  41.52 
 
 
194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  45.16 
 
 
166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  43.12 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  38.85 
 
 
164 aa  125  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  41.84 
 
 
165 aa  125  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  41.45 
 
 
164 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  37.8 
 
 
178 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  35.71 
 
 
169 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  37.58 
 
 
171 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  41.55 
 
 
167 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  37.74 
 
 
175 aa  121  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  38.93 
 
 
177 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  38.93 
 
 
177 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  38.93 
 
 
171 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  42.47 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  38.93 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  41.29 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  35.62 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  38.26 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  38.26 
 
 
165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  38.93 
 
 
165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  41.06 
 
 
160 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  38.93 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  38.26 
 
 
171 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  38.26 
 
 
178 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  39.44 
 
 
167 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  36.49 
 
 
174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  34.84 
 
 
174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  38.93 
 
 
165 aa  118  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  41.72 
 
 
162 aa  117  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  41.38 
 
 
175 aa  117  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  37.58 
 
 
174 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  41.61 
 
 
174 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  36.08 
 
 
183 aa  117  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  40.14 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  36.77 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  40.14 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  34.68 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  39.62 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 
175 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 
175 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 
175 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  41.55 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  40.79 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 
175 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 
175 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  35.81 
 
 
156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  40.56 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 
175 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  36.91 
 
 
166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 
175 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  40.14 
 
 
163 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  38.36 
 
 
205 aa  115  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  36.91 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  37.75 
 
 
183 aa  114  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  34.97 
 
 
218 aa  114  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  36.91 
 
 
165 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  41.72 
 
 
158 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>